Wilhelm Oberhaus est arrêté en 1936 à cause de son sermon du , dans lequel il disait: «Les enfants, chers parents, vous appartiennent après Dieu; seulement après à l'État!» Le , il est inculpé pour une infraction à l'article 2 de la loi sur la trahison(de) par le tribunal régional de Dortmund et condamné à cinq mois d'emprisonnement.
Le , il vient à Bockwitz (aujourd'hui Lauchhammer-Mitte) en tant que vicaire de la paroisse. Au cours de la procédure judiciaire en raison d'un autre incident survenu le , il est arrêté au presbytère de Bockwitz et conduit en prison en détention à Bad Liebenwerda, Torgau et Halle-sur-Saale. Il avait giflé une fille de la Bund Deutscher Mädel à cause d'une remarque insolente et est d'abord condamné à 6 mois de prison le pour atteintes corporelles.
Après la fin de sa peine le , il reste en garde à vue à l'instigation de la Gestapo de Halle-sur-Saale et est finalement transféré au camp de concentration de Dachau le . Comme le montrent les archives du camp, sa souffrance dans le Pfarrerblock dure du jour de son admission à sa mort. Il meurt de faim et d'un phlegmon non soigné au bas de la jambe droite. Son corps est incinéré dans le crématorium du camp et les cendres envoyés à son père dans une urne.
Le père fait placer l'urne dans un cercueil en chêne. Avec la grande sympathie de nombreuses personnes de Herford, les restes du défunt sont enterrés le dans le cimetière de Herford avec la participation du vicaire général de Paderborn Friedrich Maria Rintelen(de). Les funérailles sont comme une réunion de protestation contre l'injustice nazie.
Wilhelm Oberhaus est l'un des 20 martyrs de la persécution par les nazis dans l'archidiocèse de Paderborn. La Conférence épiscopale allemande inclut le vicaire Wilhelm Oberhaus comme témoin de la foi dans le Martyrologe allemand du XXe siècle. La paroisse catholique Saint-Clément de Hombruch baptiste la maison paroissiale, achevée le , en l'honneur de Wilhelm Oberhaus. Dans l'église, il y a un vitrail en son honneur, conçu par Egon Stratmann(de).
