Diplômé en droit de l'université de Leyde en , il devient avocat à Zwolle l'année suivante.
En 1795, après la Révolution batave, il entre aux États provinciaux de l'Overijssel. Queysen est élu député de Zwolle à la première assemblée nationale batave en . Fédéraliste, il participe à la rédaction du premier projet de constitution pour la République batave qui est rejeté le par référendum. Il est réélu à l'assemblée le 1er septembre et siège au comité des Affaires extérieures. Le , il fait partie des députés arrêtés après le coup d'État unitariste de Pieter Vreede. Il est emprisonné à Hoorn puis à La Haye jusqu'au . Le , Willem Queysen est élu député d'Almelo au Corps législatif.
Le , Queysen est nommé à Régence d'État et en reste membre jusqu'à sa dissolution le et son remplacement par Rutger Jan Schimmelpenninck, devenu grand-pensionnaire de la République batave. Il siège à la section de la Marine et des colonies avec Augustijn Besier et Jacob Spoors. Le , Schimmelpenninck le nomme au Conseil d'État où il siège à la section des Lois et de l'administration générale jusqu'en décembre 1807 puis des Finances jusqu'en . En , il remplace Gerrit Pijman en tant que directeur général des Postes, jusqu'au , lorsqu'il devient préfet de la Frise orientale, rattachée au royaume de Hollande.