En 1660, Edward Hyde (1er comte de Clarendon) le trouve désireux de servir le roi, susceptible d'être utile aux sectaires, et étonnamment bien au courant des récentes négociations royalistes. Il est élu député de Winchelsea au Parlement de la Convention[2]. En 1674, il est trouvé engagé dans une correspondance secrète avec la Hollande, et passa plusieurs mois dans la tour de Londres et n'est libéré que sur la base d'aveux complets.
Succédant à son frère Thomas Howard, second baron Howard de Escrick comme Lord Howard en 1678, il siège au comité des de la chambre des Lords qui suit l'enquête sur Titus Oates et mène le procès de son parent, William Howard (1er vicomte Stafford). En 1681, il est à nouveau envoyé à la Tour sous la fausse accusation d'Edward Fitzharris, qui a écrit le Vrai Anglais. Algernon Sydney obtient sa libération (). À partir de ce moment-là, il fait partie du parti "country party" (Whig).
Il est arrêté sur les premières rumeurs concernant le Complot de Rye-House et devient informateur lors du procès de William Russell (). Il donne des comptes rendus de réunions chez John Hampden et Russell, qui conduisent principalement à la condamnation de Russell. Son témoignage a également ruiné Sidney, bien que Henry Booth (1er comte de Warrington), ait eu la chance d’être jugé par ses pairs, qui ne croyaient pas aux accusations de Howard contre lui. Lui-même est gracié et est mort dans l'obscurité à York en .
Par son épouse Frances, fille de James Bridgman et nièce d'Orlando Bridgman, il a six enfants, dont Charles, quatrième baron, à la mort duquel le titre s'éteint en 1715.
Il est l'un des hommes les plus détestés et méprisés de son âge: John Evelyn l'appelait "ce monstre d'homme".