Yangdon Dhondup est née en Inde. Elle a été scolarisée en Suisse. Elle est diplômée en études chinoises de la School of Oriental and African Studies (SOAS) de l'université de Londres.
En 1999, Yangdon Dhondup a obtenu une maîtrise en études chinoises et en politique à la SOAS à l’université de Londres. En 2004, dans cette même université, elle a soutenu sa thèse sur « la littérature tibétaine contemporaine en chinois ». Elle est traductrice depuis le chinois vers l’anglais.
Elle fut conseillère pour le documentaire Angry Monk - Réflexions sur le Tibet, un film suisse du réalisateur Luc Schaedler sorti en 2005. Outre la recherche dans les archives, elle a fait plusieurs interviews pour le script. En 2006, ce film a été nommé pour le Grand Prix du Jury au Festival du film de Sundance.
Elle est actuellement une chercheuse dans le département d'Études des religions à SOAS, l'université de Londres. Ses cours portent sur bouddhisme tibétain.