サーチュイン1

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サーチュイン1: sirtuin 1SIRT1)は、ヒトではSIRT1遺伝子によってコードされているタンパク質である[5][6][7]

PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
記号SIRT1, SIR2L1, SIR2, hSIR2, SIR2alpha, Sirtuin 1
染色体10番染色体 (ヒト)[1]
概要 SIRT1, PDBに登録されている構造 ...
SIRT1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

4I5I, 4IF6, 4IG9, 4KXQ, 4ZZH, 4ZZI, 4ZZJ, 5BTR

識別子
記号SIRT1, SIR2L1, SIR2, hSIR2, SIR2alpha, Sirtuin 1
外部IDOMIM: 604479 MGI: 2135607 HomoloGene: 56556 GeneCards: SIRT1
遺伝子の位置 (ヒト)
10番染色体 (ヒト)
染色体10番染色体 (ヒト)[1]
10番染色体 (ヒト)
SIRT1遺伝子の位置
SIRT1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点67,884,656 bp[1]
終点67,918,390 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
10番染色体 (マウス)
染色体10番染色体 (マウス)[2]
10番染色体 (マウス)
SIRT1遺伝子の位置
SIRT1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点63,154,784 bp[2]
終点63,217,483 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 transcription corepressor activity
protein domain specific binding
core promoter sequence-specific DNA binding
protein C-terminus binding
keratin filament binding
転写因子結合
金属イオン結合
HLH domain binding
酵素結合
protein deacetylase activity
histone binding
血漿タンパク結合
NAD-dependent histone deacetylase activity
NAD-dependent protein deacetylase activity
histone deacetylase activity
p53結合
マイトジェン活性化プロテインキナーゼ結合
deacetylase activity
bHLH transcription factor binding
NAD+ binding
identical protein binding
NAD+ ADP-ribosyltransferase activity
加水分解酵素活性
NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
細胞の構成要素 細胞質
nuclear envelope
rDNA heterochromatin
chromatin silencing complex
ミトコンドリア
細胞核
ESC/E(Z) complex
核小体
クロマチン
核質
PML body
核内膜
細胞質基質
生物学的プロセス cellular triglyceride homeostasis
positive regulation of MHC class II biosynthetic process
DNA synthesis involved in DNA repair
positive regulation of protein phosphorylation
positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
周期的プロセス
single strand break repair
筋発生
histone H3-K9 deacetylation
negative regulation of cellular response to testosterone stimulus
regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway
DNA損傷刺激に対する細胞応答
regulation of bile acid biosynthetic process
DNA複製
negative regulation of TOR signaling
positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
regulation of glucose metabolic process
rDNA heterochromatin assembly
negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
DNA methylation-dependent heterochromatin assembly
概日リズム
positive regulation of cellular senescence
精子発生
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
cellular response to ionizing radiation
negative regulation of helicase activity
cholesterol homeostasis
response to leptin
cellular response to hypoxia
triglyceride mobilization
negative regulation of prostaglandin biosynthetic process
proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
アポトーシス
peptidyl-lysine deacetylation
negative regulation of fat cell differentiation
negative regulation of peptidyl-lysine acetylation
regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of adaptive immune response
stress-induced premature senescence
negative regulation of androgen receptor signaling pathway
negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
酸化ストレスへの反応
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
遺伝子発現の負の調節
transcription, DNA-templated
negative regulation of cAMP-dependent protein kinase activity
pyrimidine dimer repair by nucleotide-excision repair
response to insulin
histone H3-K9 modification
positive regulation of macroautophagy
positive regulation of cholesterol efflux
protein ubiquitination
negative regulation of cell growth
positive regulation of macrophage apoptotic process
rRNA processing
regulation of brown fat cell differentiation
negative regulation of phosphorylation
viral process
DNA修復
negative regulation of neuron death
positive regulation of histone H3-K9 methylation
negative regulation of histone H3-K14 acetylation
negative regulation of protein kinase B signaling
細胞分化
ovulation from ovarian follicle
regulation of protein serine/threonine kinase activity
negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator
protein ADP-ribosylation
leptin-mediated signaling pathway
negative regulation of apoptotic process
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
chromatin organization
negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
circadian regulation of gene expression
protein deacetylation
fatty acid homeostasis
protein destabilization
regulation of mitotic cell cycle
positive regulation of cAMP-dependent protein kinase activity
white fat cell differentiation
positive regulation of insulin receptor signaling pathway
negative regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
peptidyl-lysine acetylation
過酸化水素への反応
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator
negative regulation of histone H4-K16 acetylation
positive regulation of endothelial cell proliferation
regulation of smooth muscle cell apoptotic process
behavioral response to starvation
cellular glucose homeostasis
cellular response to starvation
cellular response to tumor necrosis factor
positive regulation of DNA repair
多細胞個体の発生
regulation of cell population proliferation
positive regulation of cell population proliferation
regulation of endodeoxyribonuclease activity
regulation of cellular response to heat
positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
negative regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
UV-damage excision repair
histone deacetylation
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
血管新生
macrophage cytokine production
regulation of lipid storage
positive regulation of adipose tissue development
macrophage differentiation
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of smooth muscle cell differentiation
negative regulation of histone H3-K9 trimethylation
positive regulation of apoptotic process
cellular response to hydrogen peroxide
histone H3 deacetylation
negative regulation of protein acetylation
regulation of apoptotic process
cellular response to leukemia inhibitory factor
positive regulation of angiogenesis
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
positive regulation of blood vessel endothelial cell migration
negative regulation of cellular senescence
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001142498
NM_001314049
NM_012238

NM_001159589
NM_001159590
NM_019812

RefSeq
(タンパク質)

NP_001135970
NP_001300978
NP_036370

NP_001153061
NP_062786

場所
(UCSC)
Chr 10: 67.88 – 67.92 MbChr 10: 63.15 – 63.22 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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SIRT1は、最初に発見されたサーチュインである出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeのSir2のホモログである。主に細胞核に位置し、細胞機能の調節(特にストレス応答や長寿)に寄与する転写因子の脱アセチル化を担う酵素である[8][9]

機能

SIRT1はサーチュインファミリーの一員であり、出芽酵母のSir2のホモログである。サーチュインファミリーのメンバーはサーチュインコアドメインによって特徴づけられ、さらに4つのクラスに分類される中でSIRT1はクラスIに属する。酵母のサーチュインタンパク質はエピジェネティックな遺伝子サイレンシングを調節し、またリボソームDNA(rDNA)の組換えを抑制することが知られている[6]

SIRT1はインスリン抵抗性が高い細胞でダウンレギュレーションされている[10]。SIRT1は、代謝調節に必要不可欠な転写因子であるPGC-1α/ER-α複合体の両者を脱アセチル化し、その活性に影響を及ぼすことが示されている[11][12]。また、SIRT1はp53タンパク質を脱アセチル化し不活性化することがin vitroで示されており[6]Th17細胞の活性化にも関与している可能性がある[13]

ホモログの機能

SIRT1の酵母ホモログであるSir2は、最初に発見されたサーチュインである。サーチュインファミリーは高度に保存されており、研究されているほぼすべての生物でこのファミリーに属するタンパク質が発見されている[14]。サーチュインはストレス(熱や飢餓など)に対する応答に重要な役割を果たしており、またカロリー制限による寿命伸長効果を担っていると考えられている[15][16]

作用機序と観察される影響

サーチュインは主に、NAD+の存在下において、タンパク質内のアセチル化されたリジン残基からアセチル基を除去することで作用する。そのため、NAD+依存性脱アセチル化酵素に分類される[17]。サーチュインはタンパク質からNAD+ADP-リボース部分へアセチル基を転移し、O-アセチル-ADP-リボースを形成する。Sir2のヒストン脱アセチル化活性は標的遺伝子座のクロマチン構造のパッケージングをより強固なものにし、転写の低下をもたらす。こうしたSir2のサイレンシング活性はテロメア領域、HM遺伝子座、rDNA遺伝子座(RDN1)において最も顕著である。

酵母細胞の寿命を母細胞が細胞死までに行う細胞分裂の回数として定義して測定した場合、Sir2の限定的な過剰発現は約30%の寿命伸長効果をもたらす。また、Sir2の欠失は寿命を50%短縮させる[18]。特に、HM遺伝子座においてSir2はSir3やSir4と複合体を形成してサイレンシング活性を発揮し、双方の接合型遺伝子が同時に発現して不稔や寿命短縮が生じることを防いでいる[19]。さらにrDNA遺伝子座におけるSir2活性はERC(extrachromosomal rDNA circle)と呼ばれる環状DNA形成の減少と相関している。ERCはrDNAの反復配列間での相同組換えによって形成されるが、Sir2活性によるクロマチンサイレンシングは相同組換えを低下させる。ERCの蓄積は酵母の「老化」の主要な機構であると考えられており、そのためSir2の作用によるERC蓄積の防止が酵母の長寿に必要な因子となっていると考えらえている[19]

酵母細胞は飢餓条件下でも同様に寿命が伸長するが、実際に飢餓によって利用可能なNAD+量の増大とニコチンアミドの減少が引き起こされ、そのどちらもがSir2活性の亢進に寄与している可能性がある[20]。さらに、SIR2遺伝子の変異によってカロリー制限による寿命伸長効果は消失する[21]。線虫Caenorhabditis elegansキイロショウジョウバエDrosophila melanogasterで行われた実験でもこうした知見は支持されている[22]。一方で、一部の研究ではこうした解釈に疑問を生じさせる結果も得られている。酵母細胞の寿命を非分裂段階での生存時間として定義して測定した場合、SIR2遺伝子のサイレンシングは寿命の伸長をもたらすこととなる[23]。さらに、Sir2が存在しない場合でもカロリー制限によって寿命が大きく伸長することを示す結果も得られている[24]

キイロショウジョウバエではSir2は必須ではなく、遺伝子の喪失は非常にわずかな影響を及ぼすのみである[25]。一方、Sirt1遺伝子を欠失したマウスは出生段階で正常なマウスよりも小さく、多くの場合早期に致死もしくは不妊となる[26]

SIRT1の阻害

ヒトの老化は慢性的な低レベルの炎症によって特徴づけられ[27]、炎症と関連した遺伝子の主要な転写調節因子となっているのはNF-κBである[28]。SIRT1はNF-κBのRelA/p65英語版サブユニットのリジン310番を脱アセチル化することで、NF-κBによって調節されている遺伝子の発現を阻害する[29][30]。一方で、NF-κBはより強力にSIRT1を阻害する。NF-κBはマイクロRNAmiR-34aのプロモーター領域に結合することで発現を高め、miR-34aはSIRT1のmRNAの3' UTRに結合することで発現を抑制する[31]

SIRT1とPARP1は、どちらも活性化にNAD+を必要とする酵素である[32]。PARP1はDNA修復酵素であり、そのためDNA損傷が大きい条件下ではNAD+濃度は低下し、それによってSIRT1の活性も20–30%低下する[32]

相同組換え

ヒト細胞ではSIRT1は相同組換えを促進し、組換えによるDNA切断修復を促進していると考えられている[33]。SIRT1を介した相同組換えにはWRNタンパク質を必要とする[33]。WRNはRecQヘリカーゼ英語版に分類されるタンパク質であり、相同組換えによる二本鎖切断修復において機能するタンパク質である[34]。WRNの変異はウェルナー症候群の原因となり、この疾患は早老の多くの特徴を示す。これらの知見は、SIRT1の機能は相同組換えと関連しており、相同組換えは老化時にゲノムの完全性を維持するために必要である可能性が高いことを示唆している[33]

選択的リガンド

活性化因子

  • ラミンA早老症に関する研究において、SIRT1を直接的に活性化する因子として同定された[35]
  • レスベラトロールはSIRT1の活性化因子であるという主張があるが[36]、当初使用されていた活性アッセイでは非生理的な基質ペプチドが用いられていたため実験的アーティファクトである可能性があり、その作用については議論がある[37][38]。レスベラトロールはSIRT1の発現を高め、すなわち必ずしも直接的な活性化ではない形でSIRT1の活性を高めている可能性がある[10]。その後、人為的改変がなされていない基質ペプチドに対してもレスベラトロールがSIRT1を直接活性化することが示された[39][40]。また、レスベラトロールはSIRT1とラミンAとの結合も強化する[35]。レスベラトロール以外にも、さまざまな植物由来ポリフェノールがSIRT1と相互作用することが示されている[41]
  • SRT-1720英語版は活性化因子としての主張がなされたが[36]、現在ではその効果は疑問視されている[42]
  • メチレンブルーNADH/NAD+比を高めることでSIRT1を活性化する[43]
  • メトホルミンAMPKとSIRT1の双方を活性化する[44]
  • ミリカノール英語版はSIRT1を活性化する[45]

レスベラトロール、そしておそらくSRT-1720はAMPKを活性化し、AMPKがSIRT1の活性に必要な補因子であるNAD+の濃度を高めることで間接的にSIRT1を活性化する[46][47][48]。NAD+濃度の上昇は、SIRT1を活性化するための信頼性の高い手法である[48]

阻害因子

相互作用

SIRT1は、ERRα英語版[11]およびAIRE英語版[49]と相互作用することがin vitroで示されている。インタラクトーム英語版研究では、多くの過程に関与する136種類の因子と直接的相互作用を行うことが報告されている[50]

出典

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Wikiwand AI