ウィーン大学で天文学が教えられたのは14世紀に溯ることができる。1365年のウィーン大学の設立後まもない1391年から1882年まで天空と地上に関する講義は行われてきた。15世紀にはグムンデンのヨハネス、ゲオルグ・プールバッハ、レギオモンタヌスなどの天文学者がいた。18世紀の初めにオーストリアの主計長官を務めたJohann Jakob Marinoniがウィーンの自宅に観測塔を建てたのに影響をうけて1733年にはイエズス会が観測所の屋根に塔を建てた。
マリア・テレジアの裁可をえて大学に天文台が建設されることになり、現在はオーストリア科学アカデミーの本部になっている大学の建物の階上に設けられ、1756年に使用が始められた。初代の天文台長には35歳のイエズス会士マクシミリアン・ヘルが任命された。ヘルの指導の下で、ウィーン天文台は国際的に評価を高めた。ヘルは37巻におよぶ著書"Ephemerides astronomicae ad meridianum Vindobonensem"を出版した。金星の日面通過を1761年にウィーン天文台で1769年にはノルウェーのVerdoで観測し、太陽までの距離を14960万kmであると計算した。天文観測のほかに緯度の基準の点となり、正確な時刻の計測を行い、気象観測も行った。