バイエルン公ゲオルクとその妻のポーランド王女ヤドヴィガの間の長女として生まれた。兄ルートヴィヒ（1496年より前に早世）の死後、男子相続者のいなくなったバイエルン＝ランツフート公爵家の相続問題の中心人物となる。もっとも、1392年及び1450年に結ばれたヴィッテルスバッハ家の家内法に拠れば、男子相続者の絶えた家系の領地は、同族の男系男子が相続することが定められていた。
父ゲオルクは、家内法に反して1496年9月19日付けの遺言状により、娘エリーザベトを自身の相続人・後継者と定めた。1499年2月10日、プファルツ選帝侯フィリップの三男で、3歳年下の従弟にあたるループレヒトと結婚した。夫との間に4人の息子をもうけ、うち2人が成人した。
- ループレヒト（1500年 - 1504年、双子の兄）
- ゲオルク（1500年 - 1504年、双子の弟）
- オットハインリヒ（1502年 - 1559年） - プファルツ＝ノイブルク公、プファルツ選帝侯
- フィリップ（1503年 - 1548年） - 「喧嘩好き（Philipp der Streitbare）」、プファルツ＝ノイブルク公
1503年、父公爵はエリーザベトの夫をニーダーバイエルン地方の総督に任命した。同年12月1日に父が死去した後、エリーザベトはランツフート公領の相続を断固として主張、等族議会が設置した摂政委員会と決定的な対立を引き起こし、ランツフート継承戦争（ドイツ語版）が勃発する。
相続権を争うバイエルン＝ミュンヘン公爵家の当主アルブレヒト4世はエリーザベトよりも多くの重要な同盟者を味方に付け、ローマ王マクシミリアン1世もミュンヘン公爵家支持に回った。1504年8月20日、帝国アハト刑を宣告されていた夫ループレヒトが赤痢に罹って死んだ。エリーザベトは未亡人となっても戦いを続け、ランツフート、ディンゴルフィンク（ドイツ語版）、モースブルク（ドイツ語版）の諸都市を占拠していた。
やがてエリーザベト本人にも帝国アハト刑が宣告された。1504年9月12日、エリーザベトの同盟者だったボヘミア王の軍隊がヴェンツェンバッハ（ドイツ語版）近郊で敵軍に決定的な敗北を喫した（ヴェンツェンバッハの戦い（ドイツ語版））。この戦闘の3日後、エリーザベトは死去した。死因は、当時ニーダーバイエルン地方に蔓延していた赤痢であったと推測される。公女の遺骸はゼリゲンタール修道院（ドイツ語版）に埋葬された。
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神聖ローマ帝国
バイエルン・ランツフート公領、ブルクハウゼン