当時、父親であるチャールズ・パデル（英語版）がイギリス・カーライルでカーライル文法学校の校長職を得ていたため、この地で生を受ける。母親のMòragはウィリアム・ハンターの三女にあたり、ジョン・パデルの名はウィリアムの弟ジョン・ハンターにちなんで付けられたものである。
奨学金を得てオックスフォード大学クイーンズコレッジに進学した。
1944年にはヒルダ・ホライショ・バーロウと結婚。ヒルダは著名なダーウィンの孫娘ノーラ・ダーウィン（英語版）とその夫アラン・バーロウの娘である。ジョンとヒルダは五子を儲けた。
- ニコラ・マリー・パデル(1951年生) 精神医学者・精神分析的心理療法士
- フェリックス・パデル(1955年生) 人類学者
- アダム・パデル(1956年生) 組織病理学者
