作者である押切蓮介（『ピコピコ少年SUPER』より本名の「神崎良太」表記）の幼少時よりのゲームにまつわる体験を漫画にしたもの。自伝的内容が強く、単行本の帯には「みんな実話です」と書かれている。当時の小中学生が、時には楽しく、時には親や先生や不良や仲間たちから理不尽な仕打ちを食らいながら、なおゲームを愛してやまない「ピコピコ少年」ぶりを描いている。
『ピコピコ少年SUPER』最終話は2015年1月30日から2月1日正午までの限定公開。その際「ぽこぽこ」にアクセスが集中し、ページが開きづらくなっていたことをサイト上で謝罪している。最終話では押切が『ハイスコアガール』騒動で書類送検、刑事告訴されかけていた2014年当時の話が描かれている。
『ピコピコ少年EX』1話では2016年当時ヴァニラウェアのゲーム『オーディンスフィア レイヴスラシル』の取材を受けている最中に騒動の決着を聞かされた事が語られている。
ほか、単行本に収録されなかった初期の『ピコピコ少年』の読み切り2編が押切の短編集『おばけのおやつ』（全1巻）に収録されている。