向山高校新聞部長の大林純は、校内新聞の100号記念号をスクープ記事で飾るべく校内一の美少女・今泉里美の追跡取材を試みるがことごとく失敗に終わってしまう。そこで、発明が趣味の兄・昇に相談しようとするが兄は不在。しかし、兄の机の上に飲むと10分間だけ体が小さくなるカプセル剤「強力 一寸法師の素」を発見し、無断で持ち出すことにする。
翌日、校内で一寸法師の素を飲んで小さくなった純はローアングルから女子生徒たちのパンツを覗いたり、桑名先生のストッキングをよじ登ったりしてその効能を確かめ、満を持して里美の家への侵入を試みる。