日本医学会の中で、産学連携を基盤とする唯一の学会である[要出典]。1926年に「日本医科器械学会」として発足し、2007年10月1日に現在の名称に変更した。本部は東京都文京区にあり、会員は正会員と企業会員からなる。正会員数は2015年3月31日現在4,987名で、医療機器メーカーやディーラーの社員、医師、看護師、臨床工学技士、臨床検査技師などから構成される。企業会員は、約300社である。1年に1度の大会・学術集会が開催され、機関紙『医療機器学』が隔月刊誌として発行されている。
下部組織に（財）日本医科器械資料保存協会があり、千葉県印西市に印旛医科器械歴史資料館を開設している。
