肥前国佐嘉郡飯盛城主石井駿河守忠義の三男三河守義昌の孫である。
龍造寺氏の旗本部将石井彦十郎の次男として生まれる。母は石井石見守忠繁の娘。母は佐賀藩初代藩主鍋島勝茂の再従姉にあたる。
諱は義元。「生札」の名は、佐賀藩祖鍋島直茂のかつての名乗りである「信生」（のぶなり）の一字を拝領したものである。
直茂の正室陽泰院（石井兵部少輔常延次女）とは再従兄妹の間柄で、陽泰院が初代藩主鍋島勝茂を出産した場所は、生札の屋敷であった。
若い頃から鍋島直茂と懇意であり、直茂が龍造寺氏に代わって国政を掌握する頃から、側近として重きをなす。
蓮池城の天守閣を名護屋城の櫓に移築する際には、鍋島主水佑茂里（石井茂里）や久納市右衛門茂俊と共に、奉行に名を連ねている。また、文禄・慶長の役勃発後は、石井六兵衛忠種と共に補給部隊を指揮して、物資運送の任務に従事。豊臣秀吉からその労を賞された。
関ヶ原の戦いに続く、柳川城の戦いでは、石井壱岐守茂利と共に船大将を務め、水軍を率いた。
家禄は物成410石（知行1,025石）。
佐賀藩に伝わる武士道論書『葉隠』では、生札が老年の直茂に付き従い、病床の直茂から「今晩のうちに、書院を解体したい。物音を立てずに解体せよ」との命を受けると、生札は、人足に柴の葉を咥えさせて物音を立てないように解体させたといい、直茂を「だからその方に頼んだのだ」と喜ばせる逸話が見られ、生札の機転の良さと、直茂との信頼関係の厚さを伝えている。
晩年は、戦場で多くの敵兵を殺した罪滅ぼしを思い立ち、零落していた本通寺を再建し、自ら住職となって余生を過ごした。日栄上人と呼ばれた。
慶長7年（1602年）死去。墓所は、佐賀県佐賀市高木瀬東の本通寺にある。