神宮寺

日本に仏教が伝来した飛鳥時代には、神道と仏教は未統合であったが、平安時代になり、仏教が一般にも浸透し始めると、日本古来の宗教である神道との軋轢が生じ、そこから日本の神々を護法善神とする神仏習合思想が生まれ、寺院の中で仏（本地）の仮の姿である神（権現あるいは垂迹）を祀る神社が営まれるようになった。

鎌倉時代、室町時代、江戸時代では、武家の守護神である八幡神自体が「八幡大菩薩」と称されるように神仏習合によるものであったため、幕府や地方領主に保護され、祈祷寺として栄えた。

しかし、神仏習合であるがゆえに檀家を持たなかったため、明治時代の神仏分離でほとんどの寺院が神社に転向あるいは消滅するなどし、急速に数を減らした。また、福岡県の梅岳寺のように、領主によって明治以前に改名された寺院もある。

神社と神宮寺のどちらが主体かは断言できないが、神祇のための寺院という神宮寺本来の役割を考えれば、神社なしの神宮寺はありえないため、宗教施設としては神社が中心といえる（神社がなければ神宮寺と称する必要がない）。逆に寺院のための神社の場合は、鎮守社という（この場合は寺院あっての神社であり、寺院なしの鎮守社はありえない）。