腸内細菌科

腸内細菌科（Family Enterobacteriaceae）は、プロテオバクテリア門（Proteobacteria）、ガンマプロテオバクテリア綱（Gammaproteobacteria）、エンテロバクター目（Enterobacterales）の下位に属する分類群である。

腸内細菌科に属する細菌は、以下のような形態的、生化学的な特徴を有する。

• グラム陰性の桿菌である。
• 通性嫌気性で、ブドウ糖を発酵して酸とガス（二酸化炭素および水素）を産生する。
• 通常培地でよく発育する。
• 鞭毛を持つものが多く、運動性（液体中で泳いで移動することが可能）である。鞭毛を持つものは周毛性（菌体の周囲全体に鞭毛が存在する）である。
• 硝酸塩を還元して亜硝酸にする。
• DNAのGC含量は39-59 mol%。
• 芽胞を形成しない。菌株によっては、莢膜や線毛を持つものがある。

腸内細菌科において以下の属が存在する。菌種については特に代表的なものだけを記載した。

• Arsenophonus
• Biostraticola
• Candidatus Blochmannia
• Brenneria
• Buchnera
• Budvicia
• Buttiauxella
• Cedecea
• Citrobacter
• Cosenzaea
• Cronobacter
• Dickeya
• Edwardsiella
• Enterobacter（エンテロバクター属）
• Erwinia（エルウィニア属：火傷病などの植物病原菌）
• Escherichia（大腸菌属）： E.coli（大腸菌）
• Ewingella
• Gibbsiella
• Hafnia
• Klebsiella（クレブシエラ属）：K. pneumoniae（肺炎桿菌）
• Kluyvera
• Leclercia
• Leminorella
• Lonsdalea
• Mangrovibacter
• Moellerella
• Morganella
• Obesumbacterium
• Pantoea
• Pectobacterium（ペクトバクテリウム属。黒あし病菌）
• Candidatus Phlomobacter
• Phaseolibacter
• Photorhabdus
• Plesiomonas
• Pragia
• Proteus
• Providencia
• Rahnella
• Raoultella
• Saccharobacter
• Salmonella（サルモネラ属）：S. enterica（チフス菌や食中毒性サルモネラを含む）、S. bongori
• Samsonia
• Serratia（セラチア属）：S. marcescens（セラチア菌、霊菌）
• Shigella（赤痢菌属）：S. dysenteriae（志賀赤痢菌）、S. flexneri、S. boydii、S. sonnei
• Shimwellia
• Sodalis
• Tatumella
• Thorsellia
• Trabulsiella
• Wigglesworthia
• Xenorhabdus
• Yersinia（エルシニア属）:Y. pestis（ペスト菌）、Y. pseudotuberculosis（偽結核菌）、Y. enterocolitica（腸炎エルシニア）
• Yokenella

模式属は大腸菌属(Escherichia Castellani and Chalmers 1919)であり、エンテロバクター属(Enterobacter Hormaeche and Edwards 1960)ではない。本来であれば腸内細菌科の学名はEscherichiaceaeとなるはずだが、国際細菌命名規約の例外規定としてエンテロバクター科 (Enterobacteriaceae Rahn 1937) が定められている。