AMBER
Software
From Wikipedia, the free encyclopedia
Assisted Model Building with Energy Refinement (AMBER) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen (MD) von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA. Weiterhin wird mit AMBER eine Reihe von Kraftfeldern in Verbindung gebracht.
| AMBER | |
|---|---|
| Basisdaten | |
| Entwickler | University of California, San Francisco: Peter Kollman, David Case, Tom Cheatham, Ken Merz, Adrian Roitberg, Carlos Simmerling, Ray Luo, Junmei Wang, Ross Walker |
| Erscheinungsjahr | 2002 |
| Aktuelle Version | Amber18[1], AmberTools18[1][2] (Format invalid) |
| Betriebssystem | Unix (Linux[3]), MacOS[3][2] und Cygwin[3] |
| Programmiersprache | C, C++ und Fortran 90[4] |
| Kategorie | Simulationssoftware |
| Lizenz | Amber: proprietär (Industrie: $20.000[5]; Hochschulen: $500[5]) AmberTools: GPL, public domain, andere open-source |
| deutschsprachig | nein |
| ambermd.org | |
AMBER-Kraftfeld
Weblinks
- AMBER-Website (englisch)
- Amber16 und AmberTools17 Manual (englisch)
- AMBER-Tutorials (englisch)
- VMD (englisch) – Visualisierung von AMBER-Trajektorien