AMBER

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Assisted Model Building with Energy Refinement (AMBER) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen (MD) von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA. Weiterhin wird mit AMBER eine Reihe von Kraftfeldern in Verbindung gebracht.

Schnelle Fakten Basisdaten ...
AMBER
Basisdaten
Entwickler University of California, San Francisco: Peter Kollman, David Case, Tom Cheatham, Ken Merz, Adrian Roitberg, Carlos Simmerling, Ray Luo, Junmei Wang, Ross Walker
Erscheinungsjahr 2002
Aktuelle Version Amber18[1], AmberTools18[1][2]
(Format invalid)
Betriebssystem Unix (Linux[3]), MacOS[3][2] und Cygwin[3]
Programmier­sprache C, C++ und Fortran 90[4]
Kategorie Simulationssoftware
Lizenz Amber: proprietär (Industrie: $20.000[5]; Hochschulen: $500[5])
AmberTools: GPL, public domain, andere open-source
deutschsprachig nein
ambermd.org
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AMBER-Kraftfeld

Das Kraftfeld AMBER ist neben den CHARMM- und GROMOS-Kraftfeldern heute eines der am meisten verwendeten und wird von einer Reihe von weiteren Programmen wie beispielsweise NAMD unterstützt.[6] Die Kraftfelder werden dabei kostenlos mit AmberTools zum Download bereitgestellt.

Einzelnachweise

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