Jordarchaeum
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„Candidatus Jordarchaeum“ (GTDB: Jordiarchaeum[2]) und „Candidatus Freyarchaeum“ sind Kandidaten-Gattungen der Asgard-Archaeen (Phylum Promethearchaeota bzw. Asgardarchaeota wie in der GTDB,[2] monotypisch im Reich Promethearchaeati).[3][4][1][5][6][7] „Candidatus Freyrarchaeum“ ist eine weitere Kandidaten-Gattung von Archaeen (Reich Promethearchaeati), die aber gemäß LPSN und NCBI-Taxonomie einem eigenen Phylum „Candidatus Freyrarchaeota“ (laut NCBI innerhalb des Reichs Promethearchaeati) zugeordnet wird.[8][9]
| Jordarchaeum madagascarense | ||||||||||||
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| Systematik | ||||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name der Klasse | ||||||||||||
| „Ca. Jordarchaeia“ | ||||||||||||
| Sun et al. 2024[1] | ||||||||||||
| Wissenschaftlicher Name der Ordnung | ||||||||||||
| „Ca. Jordarchaeaceae“ | ||||||||||||
| Sun et al. 2024[1] | ||||||||||||
| Wissenschaftlicher Name der Familie | ||||||||||||
| „Ca. Jordarchaeaceae“ | ||||||||||||
| Sun et al. 2024[1] | ||||||||||||
| Wissenschaftlicher Name der Gattung | ||||||||||||
| „Ca. Jordarchaeum“ | ||||||||||||
| Sun et al. 2024[1] | ||||||||||||
| Wissenschaftlicher Name der Art | ||||||||||||
| „Ca. Jordarchaeum madagascariense“ | ||||||||||||
| Sun et al. 2021[1] |
Mit Stand 7. Januar 2026 gibt es vorschlagsgemäß nur jeweils eine Art in diesen Gattungen,
- „Ca. Jordarchaeum madagascariense“,[1][6] [Schreibvariante „Ca. Jordarchaeum madagascarense“[6]] mit Referenzstamm (MAG) EB_bin_7,[5][7]
- „Ca. Freyarchaeum deiterrae“[5][7] mit Referenzstamm (MAG) SRVP19_Freyarchaeia-1[7]
- „Ca. Freyrarchaeum guaymasense“ mit Referenzstamm (MAG) GB_128[8][9]
Die Genome Taxonomy Database (GTDB) listet zu diesen Gattungen noch weitere Stämme (MAGs), wobei sie die Gattung „Ca. Freyarchaeum“ mit „Ca. Jordarchaeum“ (dort Jordiachaeum genannt) synonymisiert. Die Familie „Ca. Freyarchaeaceae“ (dort Freyrarchaeaceae genannt) verbleibt aber mit einer zusätzlichen Metagenomik-Gattung (provisorische Bezeichnung DTBI01).[2] Mit einher geht eine abweichende Aufteilung der Stämme, Spezies und Gattungen auf die beiden Familien.[A. 1][2]
Die beide Familien enthaltenden höheren Taxa (Ordnung bis Klasse) sind in der GTDB synonymisiert. Als Phylum ist dort Asgardarchaeota angegeben (heute offiziell Promethearchaeota, monotypisch im Reich Promethearchaeati), d. h. übereinstimmend die Asgard-Archaeen.[2]
| Gattung | Ca. Jordarchaeum LPSN,[1] NCBI[6] | Ca. Freyarchaeum LPSN,[5] NCBI[7] | Jordiarchaeum GTDB[2] |
|---|---|---|---|
| Familie | „Ca. Jordarchaeaceae“ | Ca. Freyarchaeaceae (nur LPSN) | Jordiarchaeaceae |
| Ordnung | „Ca. Jordarchaeales“ | incertae sedis | Jordiarchaeales |
| Klasse | „Ca. Jordarchaeia“ | „Ca. Freyarchaeia“ (nur LPSN) | Jordiarchaeia |
| Phylum | Promethearchaeota (nur LPSN) | Promethearchaeota (nur LPSN) | Asgardarchaeota |
| Reich | Promethearchaeati | Promethearchaeati | – |
Diese Tabelle berücksichtigt lediglich die Hauptgruppen, einzelne Spezies oder Stämme können anderweitig zugeordnet sein (s. u.).
Systematik
Die derzeit akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[1][5] und dem National Center for Biotechnology Information (NCBI),[6][7] ergänzt um Einträge aus der Genome Taxonomy Database (GTDB),[2] Stand: 7. Januar 2026:
- GTDB-Familie Jordiarchaeaceae (ersatzweise NCBI-Familie Jordarchaeaceae):
Gattung „Candidatus Jordarchaeum“ Sun et al. 2021(L,N)[10] [Jordiarchaeum(G)]
- Spezies „Ca. Jordarchaeum madagascariense“ Sun et al. 2021(L,N)[10] [„Ca. Jordarchaeum madagascarense“ corrig. Sun et al. 2021(N), Jordiarchaeum madagascariense(G)]
- Stamm EB_bin_7(L,N,G) – Fundort: von versteinerten Knochen ausgestorbener Elefantenvögel, zw. Amparihinkisoa[11] und Soanierana[12], Madagaskar. Genomlänge: 3,68 Mbp(N)
Gattung „Candidatus Freyarchaeum“ Valentin-Alvarado et al. 2024(L,N)[3][13] [Jordiarchaeum(G)]
- Spezies „Ca. Freyarchaeum deiterrae“ Valentin-Alvarado et al. 2024(L,N)[3][13] [Ca. Freyarchaeota archaeon SRVP19_Freyarchaeia-1(N), Jordiarchaeum deiterrae(G)]
- Stamm SRVP19_Freyarchaeia-1(N,G)[3][13] – Fundort: aus Bodensedimenten in Kalifornien. Genomlänge: 3.58 Mbp(N)[3]
- Spezies Jordiarchaeum sp030587365(G) [Ca. Freyarchaeota archaeon isolate SQRJ_82(N), Ca. Freyarchaeota archaeon isolate SQRJ_26(N), Ca. Jordarchaeaceae archaeon isolate DRTY-6_201808_bins_73(N), Ca. Jordarchaeaceae archaeon isolate JZ-2_201705_bins_82(N), Ca. Jordarchaeaceae archaeon isolate HHBFW-2_201803_bins_36(N)]
- Spezies Jordiarchaeum sp018383815(G) [Ca. Jordarchaeia archaeon isolate QZM_A2(N), Ca. Jordarchaeia archaeon isolate QZM_A2_3(N), Ca. Jordarchaeia archaeon isolate QZM_A3(N)]
- Stamm QZM_A2(N,G) – Fundort: Metagenom aus Thermalquelle, Gemeinde Quchomo (alias Qǔzhuómù, QuZhuoMu) im Kreis Cona (Shannan) (alias CuoNa, Tshona), Tibet(N)
- Stamm QZM_A2_3(N,G) alias QZMA23B3 – Fundort: ebenda(N) (siehe Asgardviren)
- Stamm QZM_A3(N,G) – Fundort: ebenda(N)
- Spezies Jordiarchaeum sp029856435(G) [Ca. Jordarchaeia archaeon isolate RPF2(N)]
- Stamm RPF2(N,G)
- Spezies Ca. Jordarchaeum sp. EBB7(N) − nicht in der GTDB
- Stamm EBB7(N)
- Spezies Ca. Jordarchaeum sp. ERP4(N) − nicht in der GTDB
- Stamm ERP4(N)
- GTDB-Familie Freyrarchaeaceae:
Gattung „Candidatus Freyrarchaeum“ Xie et al. 2022(L,N)
- Spezies „Ca. Freyrarchaeum guaymasense“ corrig. Xie et al. 2022(N) [„Ca. Freyrarchaeum guaymasensis“ Xie et al. 2022(N)]
- Stamm GB_128 alias GB128 – Fundort: marines Metagenom vom Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien(N)
- Spezies Freyrarchaeum sp029258835(G) [Ca. Jordarchaeia archaeon isolate B36_G16(N), Thermoproteota archaeon isolate S9B3_HD70(N)]
- Stamm S9B3_HD70(N,G) – Fundort: Metagenom von Hydrothermalem Schlot, Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien(N)
- Stamm B36_G16(N,G) – Fundort: Metagenom von marinem Sediment, Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien(N)
Gattung DTBI01(G)
- Spezies DTBI01 sp019057715(G) [Ca. Jordarchaeum sp. JNZ_1113(N)]
- Stamm JNZ_1113(N,G)
- Spezies DTBI01 sp019057675(G) [Ca. Jordarchaeum sp. LHC_1308(N)]
- Stamm LHC_1308(N,G)
- Spezies DTBI01 …(G)
- L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ)[1][8][5]
- N – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)[6][9][7]
- G – Genome Taxonomy Database (GTDB)[2]
In der GTDB hat die Gattung Jord(i)archaeum (Fam. Jord(i)archaeaceae) einige Mitglieder an die Gattung DTBI01 (Fam. Frey(r)archaeaceae) abgegeben, andererseits aber die Gattung Freyarchaeum (von dieser Familie) aufgenommen.
Das folgende Kladogramm gibt die Taxonomie in vereinfachter Form an:
| Asgard-Archaeen |
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Beschreibung
Aus dem Genom abgeleitete Rückschlüsse auf den Stoffwechsel (Metabolismus) lassen vermuten, dass beiden Klassen „Ca. Jordarchaeia“ und „Ca. Sifarchaeia“ hetero-organotrophe Acetogene (Säurebildner) darstellen, die auch die Fähigkeit besitzen, Methylgruppen wie methylierte Amine zu verwerten, wobei Acetat das wahrscheinliche Endprodukt in den in diesen Gruppen im Lauf ihrer Evolution verbliebenen Überresten des Kern-Stoffwechsele ihrer methanogene n Vorfahren ist. Sun et al. (2021) nahmen an, dass dieser abgeleitete Modus der Energieerhaltung durch Erweiterungen des genetischen Codes, d. h. durch die Umcodierung von Stoppcodons, verbessert wurde, wodurch die Einbindung der seltenen 21. und 22. Aminosäuren Selenocystein (Sec) bei „Ca. Jordarchaeia“ bzw. Pyrrolysin (Pyl) bei „Ca. Sifarchaeia“ ermöglicht wird. Sec-Recodierung wurde nicht nur in „Ca. Jordarchaeia“, sondern auch in anderen Klassen der Asgard-Archaeen gefunden, von denen angenommen wird, dass sie von erhöhten katalytischen Aktivitäten Sec-haltiger Enzyme profitieren.[10]
Etymologie
Der neulateinische Gattungsname Jordiarchaeum bzw. Jordarchaeum ist benannt nach der Göttin der Erde Jörd (oder Jord) der nordischen Mythologie, die am meist mit Liebe und Fruchtbarkeit in Verbindung gebracht wird; der Suffix stammt von altgriechisch ἀρχαῖος archaîos, deutsch ‚archaisch‘, latinisiert zu archaeum ‚Archaeon‘; der Name bezeichnet also das „Archaeon der Freya“.[1]
Der ebenfalls neulat. Gattungsname Freyarchaeum ist benannt nach der nordische Göttin Freya; der Suffix ist wieder derselbe.[5]
Im Gegensatz dazu verweist der neulat. Gattungsname Freyrarchaeum auf den nordische Gott Freyr, der Gott des Friedens in der nordischen Mythologie.[8]
- Der Artnamenszusatz madagascariense bzw. madagascarense ist ein neulat. Adjektiv mit der Bedeutung ‚von Madagaskar‘ oder ‚zu Madagaskar gehörend‘.[1]
- Der Artnamenszusatz deiterrae kommt von lateinisch dea ‚Göttin‘ (bzw. dem Genitiv von deus ‚Gott‘) und dem Genitiv von terra ‚Erde‘, meint also „der Göttin (des Gottes) der Erde“.[5]