ADMIXTOOLS
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- Nick Patterson
- David Reich
| ADMIXTOOLS | ||
|---|---|---|
| Información general | ||
| Tipo de programa | software | |
| Desarrollador |
| |
| Información técnica | ||
| Programado en | R | |
| Versiones | ||
| Última versión estable | 8.0.26 de septiembre de 2024 | |
| Enlaces | ||
ADMIXTOOLS (o AdmixTools) es un paquete de software utilizado principalmente para analizar la mezcla genética en genética de poblaciones. La versión original fue desarrollada como un conjunto de programas en C independientes por Nick Patterson y su equipo fue publicada en 2012.[1][2] Una versión reimplementada, ADMIXTOOLS 2, fue desarrollada como un paquete en R por Robert Maier y su equipo y publicada en 2023.[3][4] La mayoría de los programas de ADMIXTOOLS se basan en el ajuste de modelos demográficos a f-estadísticos, que se calculan a partir de frecuencias alélicas poblacionales.[5]
qpGraph es un programa de software que forma parte del paquete ADMIXTOOLS[2] desarrollado por Patterson et al. (2012). qpGraph evalúa modelos de relaciones poblacionales basados en gráficos con mezcla genética.[1] Estima verosimilitudes de gráficos con una topología fija,[6][7] ajustando los parámetros del gráfico para que coincidan con los f-estadísticos observados.[8]
ADMIXTOOLS 2 añade funcionalidad para encontrar topologías de gráficos optimizadas, similar a programas como Treemix.[9]
