Al parecer, la policía dedicó miles de horas a comparar el ADN, los registros dentales y las huellas dactilares con muchos casos diferentes de personas desaparecidas. En consecuencia, su cuerpo no fue identificado hasta el 26 de junio de 1998. El ADN y los registros dentales ayudaron a confirmar la identificación.[17][18] Tras ver el programa de televisión America's Most Wanted, emitido en diciembre de 1998, en el que se documentaba el caso, el padre de Creek notificó a la policía que sospechaba que el cuerpo pertenecía a su hija.[12][19] Cuando Creek desapareció por primera vez, no se denunció su desaparición hasta pasadas cinco semanas, ya que su historial de fugas había impedido la investigación.[20] Tras la identificación, se modificaron las leyes del estado para evitar que se repitiera un caso como éste.[5][15]
En octubre de 2013, un laboratorio criminalístico de Oklahoma comenzó a reexaminar las huellas dactilares tomadas en escenas de asesinatos sin resolver.[21] En febrero de 2014, se reabrió el caso de Creek; los examinadores de un laboratorio criminalístico de Oklahoma pudieron hacer coincidir la huella de un pulgar en la bolsa de basura que ocultaba el cadáver con la de James Paul Eaton, un hombre divorciado de 36 años.[22][23] Eaton tenía diecinueve años en el momento del asesinato y vivía en Palatine (Illinois), la misma ciudad que Creek.[6][12][24] Uno de los hombres vistos con Amber a principios de febrero de 1997 se parecía mucho a Eaton.[15][25]
Las huellas dactilares de Eaton no estaban registradas en el momento del asesinato; sólo se registraron en 2000, tras su detención por posesión de parafernalia de drogas.[10][21][26] Los investigadores localizaron al sospechoso en Chicago, y el 22 de marzo recogieron colillas de cigarrillos desechadas para cotejar su ADN con el hallado en la escena del crimen.[27] Eaton fue detenido a principios de abril y encarcelado en Racine (Wisconsin).[28] Las autoridades también revisaron su ordenador, su perfil de Facebook y su teléfono, y registraron su domicilio en busca de posibles recuerdos del lugar del crimen, ya que se sospechaba que el asesino se había llevado algunas de las pertenencias de Amber.[7][29]
La policía intentó obtener una confesión de Eaton mostrándole imágenes de Creek cuando estaba viva y también mostrando fotos de su cuerpo después de que fuera encontrada.[25]
El tío de Creek, Anthony Mowers, ha expresado que cree que otras personas pueden estar involucradas en el asesinato, en particular en el transporte de Eaton y Amber a Wisconsin, diciendo que ella puede haber creído que estaba siendo llevada a la residencia de su abuela que se encontraba en el estado en ese momento.[11] La policía también ha declarado que creen que hay más personas que conocen detalles sobre el crimen.[15] Todavía no se ha informado si la mordedura en el cuerpo coincidía con los registros dentales de Eaton, lo que también ha llevado a algunos a sospechar que ha habido más responsables de la muerte de la víctima.[26] Se ha afirmado que su saliva fue encontrada en la escena, pero no se ha informado explícitamente de que la saliva estuviera en la zona de la mordedura.[13][30]
Los cargos originales de Eaton consistían en asesinato en primer grado y ocultación de un cadáver, que conllevaban una pena de cadena perpetua.[30] Se declaró inocente de ambos cargos en su comparecencia de octubre de 2014.[11] El juicio propiamente dicho estaba previsto que comenzara en noviembre de 2015.[25] Su abogado defensor declaró que no se les habían dado todas las pruebas disponibles en el caso, a pesar de los fuertes indicios de que jugó algún papel en la muerte de Creek.[9][31] Sin embargo, la conferencia previa al juicio final y el juicio se retrasaron más tarde al 31 de mayo y 6 de junio de 2016, respectivamente, ya que la defensa estaba tratando de localizar a un individuo para examinar la marca de mordedura en el cuello de Creek, así como el ADN de la escena.[32][33]
Un juez, convencido por el abogado de Eaton, dictaminó finalmente que la información que se obtuvo mediante el interrogatorio de Eaton tras su detención, incluida su reacción a las fotografías de Amber, no podía utilizarse en el juicio, ya que la policía había seguido interrogándole después de que solicitara un abogado. Los agentes de policía no reconocieron esta petición hasta la tercera vez que la hizo, el 5 de abril de 2014. Sin embargo, se dictaminó que la información obtenida por la policía al día siguiente aún podía utilizarse.[25][34]
El 25 de octubre de 2016, Eaton se declaró inocente de un cargo reducido de homicidio imprudente en primer grado. Se está investigando a otro hombre anónimo por su presunta implicación en el asesinato.[35] Eaton fue condenado a 40 años con posibilidad de libertad condicional al cabo de diez años.[36]