Mientras los quiteños llegan a Caspicorral, los realistas se refugian en Cuenca (Cuenca (Ecuador)), donde reciben un pedido de capitulación. Las autoridades españolas se niegan a rendirse, aunque la gran masa de ciudadanos conquenses siente simpatía por la Junta y la actuación del coronel Montúfar.[1]
Sin embargo, ante el posible ataque de los patriotas, un gran número de cuencanos evacuaron la ciudad, entre ellos el obispo Andrés Quintián de Ponte quien se incorporó a la ciudad de Guayaquil. Acto seguido, al no contar con los apoyos suficientes para defender la ciudad y debilitada su autoridad, el presidente Joaquín Molina presenta su renuncia irrevocable y abandona inmediatamente la ciudad.[1]
Mientras tanto, el coronel Montúfar permanece en las inmediaciones de Cuenca, luego a los pocos días se retira con sus tropas a Cañar para finalmente regresar a Quito, donde sus opositores lo acusan de no haber tomado Cuenca cuando el presidente Molina había renunciado.[1]
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