CoDIS

Combined DNA Index System (CoDIS) es la base de datos nacional de los Estados Unidos, creada y mantenida por el FBI. El CoDIS comprende tres niveles de información: sistemas de índice de ADN locales (LDIS) donde se originan los perfiles genéticos, sistemas de índice de ADN estatales (SDIS) que permite a los laboratorios de un mismo estado compartir información, y el sistema de índice de ADN nacional (NDIS) que permite a los estados comparar información entre ellos. El software del CoDIS contiene diferentes bases de datos dependiendo del tipo de información a buscar, que incluyen personas desaparecidas, delincuentes y muestras forenses de escenas de delito. Cada estado, y el sistema federal, tiene diferentes leyes que regulan la recolección, subida y análisis de la información contenida en su base de datos. Sin embargo, por razones de privacidad, la base de datos CoDIS no contiene información personal identificativa, como el nombre asociado a cada perfil genético. From Wikipedia, the free encyclopedia

Tipo Base de datos
Software

Propietario Federal Bureau of Investigation

CoDIS



Información general
Tipo	Base de datos Software
Gestión
Propietario	Federal Bureau of Investigation
[editar datos en Wikidata]

Combined DNA Index System (CoDIS) es la base de datos nacional de los Estados Unidos, creada y mantenida por el FBI. El CoDIS comprende tres niveles de información: sistemas de índice de ADN locales (LDIS) donde se originan los perfiles genéticos, sistemas de índice de ADN estatales (SDIS) que permite a los laboratorios de un mismo estado compartir información, y el sistema de índice de ADN nacional (NDIS) que permite a los estados comparar información entre ellos.

El software del CoDIS contiene diferentes bases de datos dependiendo del tipo de información a buscar, que incluyen personas desaparecidas, delincuentes y muestras forenses de escenas de delito. Cada estado, y el sistema federal, tiene diferentes leyes que regulan la recolección, subida y análisis de la información contenida en su base de datos. Sin embargo, por razones de privacidad, la base de datos CoDIS no contiene información personal identificativa, como el nombre asociado a cada perfil genético.

El CoDIS era una extensión de Grupo de Trabajo Técnico en Métodos de Análisis del ADN (TWGDAM, ahora SWGDAM) que desarrolló guías normalizadas para la práctica en laboratorios forenses en EE. UU. y Canadá, cuando comenzaron a trabajar con muestras de ADN en los años 80.

El TWGDAM fue patrocinado por el laboratorio del FBI que organizaba diversos encuentros científicos al año en Quantico, Virginia, para acelerar el desarrollo de guías de laboratorio y revisar artículos para apoyar los ensayos de ADN, que para algunos eran una herramienta forense dudosa. El TWGDAM completó un libro blanco en octubre de 1989 que daba autoridad al CoDIS para compartir perfiles de ADN entre laboratorios, de igual forma que ya se hacía con las huellas dactilares en la misma década.

El laboratorio del FBI comenzó un proyecto piloto en seis estados y laboratorios forenses locales para desarrollar un software que diera soporte a las pruebas de ADN en cada laboratorio y que permitiera compartir perfiles genéticos con otros laboratorios.

La asamblea de identificación de ADN de 1994 autorizó el establecimiento de este índice nacional de ADN. La asamblea especifica las categorías de datos que pueden almacenarse en el NDIS (delincuentes convictos, arrestados, detenidos, casos forenses, restos humanos sin identificar, personas desaparecidas y familiares de estas), así como los requerimientos para los laboratorios participantes, relacionados con la garantía de calidad, privacidad y borrado de datos.

La asamblea especifica los requerimientos de acceso a las muestras de ADN y archivos mantenidos por las agencias criminales de justicia federales, estatales y locales (o la Secretaría de Defensa, de acuerdo con la sección 1565, título 10 del código de los Estados Unidos).

Las leyes federales requieren que los laboratorios que suministren datos al NDIS esté acreditados por asociaciones profesionales sin ánimo de lucro o por personas activamente involucradas en ciencia forense, internacionalmente reconocidas por la comunidad forense. Las siguientes entidades han cumplido esta definición: la American Society of Crime Laboratory Directors/Laboratory Accreditation Board (ASCLD/LAB) y los Servicios de Calidad Forenses.

Bases científicas

La identificación en el CoDIS se basa en las repeticiones cortas en tándem (STR) presentes en el genoma humano, de entre dos y seis nucleótidos, muy susceptibles a variación en el número de repeticiones. Los loci donde se encuentran las STR pueden amplificarse usando PCR y analizarse mediante electroforesis en gel. El tamaño del fragmento de ADN es proporcional al número de repeticiones, por lo que podrán cuantificarse estas. La combinación de repeticiones en cada locus proporciona una huella genética característica de cada individuo.

Marcadores

El CoDIS identifica marcadores genéticos en trece STR, además del locus de la amelogenina (presente en los cromosomas X e Y y adecuado para determinar el sexo).

CSF1PO
D3S1358
D5S818
D7S820
D8S1179
D13S317
D16S539
D18S51
D21S11
FGA
TH01
TPOX
vWA

A partir del 1 de enero de 2017 se agregaron siete ubicaciones más^[1]

D1S1656
D2S441
D2S1338
D10S1248
D12S391
D19S433
D22S1045

Estos marcadores no solapan con los que ese usan generalmente en ensayos de ADN. Algunos pueden ser indicadores de enfermedades genéticas.

El índice del CoDIS asiste a los laboratorios forenses públicos de EE. UU. para comparar e intercambiar perfiles de ADN. Uno de sus registros, el "CODIS DNA profile", consiste en el perfil genético de un individuo, junto con el de la muestra identificativa y el identificador del laboratorio responsable del perfil. El CoDIS no es una base de datos histórica sobre delitos, como puede ser el Centro Nacional de Información Criminal (NCIC), y no contiene información personal identificativa como nombres, fechas de nacimiento o números de la seguridad social.

Originariamente, el CoDIS consistía en el índice de criminales convictos y el índice forense, pero actualmente se han añadido el índice de arrestados, el índice de personas desaparecidas o no identificadas, y el índice de referencia de personas desaparecidas.

El CoDIS tiene un algoritmo de coincidencias de búsquedas entre varios índices, de acuerdo con las reglas estrictas de protección de datos. A la hora de resolver violaciones y homicidios por ejemplo, el CoDIS compara el índice forense con el de criminales. El algoritmo solo genera una lista de candidatos, que puede ser confirmado o descartado por un analista cualificado.

Las bases de datos del CoDIS existen a nivel local, estatal y nacional. Esta estructura permite a los laboratorios controlar sus propios datos: cada laboratorio decide qué perfiles compartir con el resto del país. Desde 2006, aproximadamente 180 laboratorios de los cincuenta estados participan en el CoDIS. A nivel nacional, el sistema de índice nacional de ADN (NDIS) lo regenta el FBI en una localización sin revelar.

Tamaño relativo

El NDIS contiene más de 12 010 904 perfiles, 2 157 394 perfiles de arrestados y 663 191 perfiles forenses a fecha de octubre de 2015. Por último, el éxito del programa CoDIS se mide en el número de delitos que ayuda a resolver. "CoDIS primary metric" sigue el número de investigaciones criminales en las que el CoDIS ha contribuido al proceso de investigación. Hasta octubre de 2015, el CoDIS ha generado más de 300 050 asistencias en más de 285 447 investigaciones.

Loci

Las ubicaciones se encuentran registradas en el NIST Instituto Nacional de Estándares y Tecnología^[2]

Texto de la leyenda
Marcador	Otros nombres	Ubicación Cromosomal	Genbank Accession	Loci	Genoma	Estructura repetida	Primers	Referencia
CSF1PO	CSF, UniSTS: 156169	5q33.1	X14720	Chr 5; 149.436 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[AGAT]	5'-AACCTGAGTCTGCCAAGGACTAGC-3' (AGAT hebra), 5'-TTCCACACACCACTGGCCATCTTC-3' (TCTA hebra)	https://strbase.nist.gov/str_CSF1PO.
FGA	FIBRA, UniSTS: 240635	4q28	M64982	Chr 4; 155.866 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[TTTC]3TTTTTTCT[CTTT]nCTCC[TTCC]2	5'-GCCCCATAGGTTTTGAACTCA-3' (CTTT hebra), 5'-TGATTTGTCTGTAATTGCCAGC-3' (GAAA hebra)	https://strbase.nist.gov/str_FGA.
TH01	HUMTH01, TC11, UniSTS: 240639	11p15.5	D00269	Chr 11; 2.149 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[AATG]	5'-GTGGGCTGAAAAGCTCCCGATTAT-3' (AATG hebra) , 5'-ATTCAAAGGGTATCTGGGCTCTGG-3' (TCAT hebra)	https://strbase.nist.gov/str_TH01.
TPOX	hTPO, TPO, UniSTS: 240638	2p25.3	M68651	Chr 2; 1.472 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[AATG]	5'-ACTGGCACAGAACAGGCACTTAGG-3' (AATG hebra), 5'-GGAGGAACTGGGAACCACACAGGT-3' (TTAC hebra)	https://strbase.nist.gov/str_TPOX.
VWA	vWF, VWA31A, UniSTS: 240640	12p13.31	M25858	Chr 12; 5.963 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[TCTA] with [TCTG] and [TCCA] inserts	5'-CCCTAGTGGATAAGAATAATC-3' , 5'-GGACAGATGATAAATACATAGGATGGATGG-3'	https://strbase.nist.gov/str_VWA.
D3S1358	UniSTS: 148226	3p21.31	AC099539	Chr 3; 45.557 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[AGAT], [TCTA]	5'-ACT GCA GTC CAA TCT GGG T-3' (AGAT hebra), 5'-ATG AAA TCA ACA GAG GCT TG-3' (TCTA hebra)	https://strbase.nist.gov/str_D3S1358.
D5S818	D5 UniSTS: 54700	5q23.2	G08446, AC008512	Chr 5; 123.139 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[AGAT]	5'-GGTGATTTTCCTCTTTGGTATCC-3', 5'-[JOE]-AGCCACAGTTTACAACATTTGTATCT-3'	https://strbase.nist.gov/str_D5S818.
D7S820	, , D7, , UniSTS: 74895	7q21.11	G08616, AC004848	Chr 7; 83.433 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[GATA]	5'-[JOE]-ATGTTGGTCAGGCTGACTATG-3', 5'-GATTCCACATTTATCCTCATTGAC-3'	https://strbase.nist.gov/str_D7S820.
D8S1179	D6S502, , UniSTS: 83408	8q24.13	G08710, AF216671	Chr 8; 125.976 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[TATC]	5' - TTTTTGTATTTCATGTGTACATTCG - 3', 5' - CGTAGCTATAATTAGTTCATTTTCA - 3'	https://strbase.nist.gov/str_D8S1179.
D13S317	, , D13, , UniSTS: 7734	13q31.1	G09017, AL353628.2	Chr 13; 81.620 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[GATA]	5'-ATTACAGAAGTCTGGGATGTGGAGGA-3', 5'-[JOE]-GGCAGCCCAAAAAGACAGA-3'	https://strbase.nist.gov/str_D13S317.
D16S539	D16, , UniSTS: 45590	16q24.1	G07925, AC024591.3	Chr 16; 84.944 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[GATA]	5'-GGGGGTCTAAGAGCTTGTAAAAAG-3', 5'-[JOE]-GTTTGTGTGTGCATCTGTAAGCATGTATC-3'	https://strbase.nist.gov/str_D16S539.
D18S51	D18S379; UT574, , UniSTS: 44409	18q21.33	X91254, AP001534	Chr 18; 59.100 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[GAAA]	5'-CAA ACC CGA CTA CCA GCA AC-3' (GAAA hebra), 5'-GAG CCA TGT TCA TGC CAC TG-3'	https://strbase.nist.gov/str_D18S51.
D21S11	UniSTS: 240642	21q21.1	M84567, AP000433	Chr 21; 19.476 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[TCTA], [TCTG]	5'-GTG AGT CAA TTC CCC AAG-3', 5'-GTT GTA TTA GTC AAT GTT CTC C-3'	https://strbase.nist.gov/str_D21S11.
D1S1656	UniSTS: 58809	1q42	G07820	Chr 1; 228.972 Mb		[TAGA]n[TGA]0-1[TAGA]n[TAGG]0-1[TG]5	5'-GTGTTGCTCAAGGGTCAACT-3', 5'-[FL]-GAGAAATAGAATCACTAGGGAACC-3'	https://strbase.nist.gov/str_D1S1656.
D2S441	D2S1778, CHLC.GATA72A05, , UniSTS:71306	2p14	AC079112	chr 2: 68,213,613 bp	Julio 2003, NCBI ensamblaje del genoma humano	[TCTA]	5'-TGCACCCAACATTCTAACAA-3', 5'-ATTGGAGCTAAGTGGCTGTG-3'	https://strbase.nist.gov/str_D2S441.
D2S1338	UniSTS: 30509	2q35	AC010136, G08202	Chr 2; 218.705 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	[TGCC]n[TTCC]n		https://strbase.nist.gov/str_D2S1338.
D10S1248	CHLC.GGAA23C05	10q26.3	AL391869	chr 10: 130,566,908 bp	Julio 2003, NCBI ensamblaje del genoma humano	[GGAA]n	5'-GGAATAAGTGCAGTGCTTGG-3', 5'-ACCAATCTGGTCACAACCAT-3'	https://strbase.nist.gov/str_D10S1248.
D12S391	CHLC.GATA 11 HO8., UniSTS: 2703		G08921	Chr 12; 12.341 Mb		[AGAT]8-17[AGAC]6-10[AGAT]0-1	5'-AACAGGATCAATGGATGCAT-3', 5'-TGGCTTTTAGACCTGGACTG-3'	https://strbase.nist.gov/str_D12S391.
D19S433	CHLC.GGAA2A03, UniSTS: 33588	19q12	G08036, AC008507.6	Chr 19; 35.109 Mb	Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35	(AAGG)(AAAG)(AAGG)(TAGG)[AAGG]n		https://strbase.nist.gov/str_D19S433.
D22S1045	CHLC.ATA37D06	22q12.3	AL022314	chr 22: 35,779,368 bp	Julio 2003, NCBI ensamblaje del genoma humano	[ATT]n	5'-GCTAGATTTTCCCCGATGAT-3', 5'-ATGTAAAGTGCTCTCAAGAGTGC-3'	https://strbase.nist.gov/str_D22S1045.

CoDIS

Bases científicas

Marcadores

Tamaño relativo

Loci

Referencias

Enlaces externos

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