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Crassvirales

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Crassvirales es un orden de bacteriófagos de cola conocidos como los crAss-fagos que fue descubierto en 2014 mediante análisis computacional de datos científicos de acceso público sobre metagenomas fecales humanos (metagenómica).[1][2] Los genomas son circulares de ADN bicatenario que tienen un tamaño en torno a 97 kbp y contienen 80 marcos de lectura abierta predichos, y la secuencia se encuentra comúnmente en muestras fecales humanas.[2] En el momento del descubrimiento, se predijo que los virus infectarían principalmente a las bacterias del filo Bacteroidota las cuales son comunes en el tracto intestinal de muchos animales, incluidos los humanos.[2] Desde entonces, los bacteriófagos han sido aislados in vitro y se ha confirmado que infectan a las bacterias del filo Bacteroidota.[3] Según el análisis de datos metagenómicos, se han identificado secuencias de crAss-fagos en aproximadamente la mitad de todos los humanos muestreados.[2] Los virus recibieron el nombre del software crAss (cross-assembly)[4][5] que se utilizó para encontrar los genomas virales. Los crAss-fagos son posiblemente los primeros virus que llevan el nombre de un programa de ordenador con fines promocionales.

Si bien los crAss-fagos no tenían parientes conocidos cuando fue descubierto en 2014, se descubrió una variedad de virus relacionados en 2017.[1] Basándose en la pantalla de secuencias relacionadas en bases de datos públicas de nucleótidos y análisis filogenético, se concluyó que los crAss-fagos podrían ser parte de un orden de bacteriófagos que se encuentra en una variedad de entornos que incluyen el intestino y las heces humanas, el intestino de las termitas,[1][6][7] los ambientes terrestres y subterráneos, los lagos alcalinos (hipersalinos), y aquellos entornos de lagos con sedimentos marinos, y raíces de plantas.[1]

No hay indicios de que los crAss-fagos estén involucrados en la salud o la enfermedad humana, pero pueden superar a las bacterias indicadoras como marcador de la contaminación fecal humana.[8][9][10][11] Las bacterias indicadoras son unos tipos de bacterias empleados en la detección y valoración del nivel de contaminación de las aguas, no entrañan riesgo alguno para la salud humana pero al igual que este virus, sirven para indicar la presencia de un riesgo para la salud.

Referencias

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