En su debut en la NFL, en 1970, y después de una buena primera temporada con los Dallas Cowboys, fue comparado con Jim Brown y nombrado el novato del año en la NFL.[1] En las victorias sobre Detroit y San Francisco, Thomas corrió 135 y 143 yardas, convirtiéndose en el primer novato con dos partidos de 100 yardas en playoffs.[2]
Durante la temporada baja, Thomas pidió que se reescribiera su contrato de tres años. Cuando la gerencia de los Cowboys se negó a renegociar, calificó al presidente del equipo Tex Schramm de «embustero», al director de personal de jugadores Gil Brandt de «mentiroso» y al entrenador en jefe Tom Landryde «hombre de plástico, ningún hombre en lo absoluto»[3] Tras su negativa a presentarse al campo de entrenamiento, Thomas fue traspasado el 31 de julio de 1971 a los Patriots de Nueva Inglaterra junto con Halvor Hagen y Honor Jackson, a cambio de Carl Garrett y la primera elección de los Patriots en el draft de la NFL de 1972.[4] Al cabo de una semana, debido a problemas con los Patriots y el entrenador John Mazur,[5] en una medida sin precedentes, el comisionado de la NFL Pete Rozelle anuló parte del intercambio, enviando a Thomas y Garrett de vuelta a sus equipos originales.[6]
En octubre de 1971, Thomas anotó el primer touchdown en el Texas Stadium contra los Patriots. Esa misma temporada, Thomas lideró la liga en touchdowns de carrera (11) y touchdowns totales (13). También fue nombrado All-Pro y lideró a los Cowboys con 95 yardas de carrera y un touchdown en la victoria por 24-3 de Dallas sobre los Miami Dolphins en el Super Bowl VI, la primera de la franquicia.
Durante la temporada baja de 1972 se volvió aún más aislado e insubordinado, por lo que fue traspasado a San Diego Chargers por Mike Montgomery y Billy Parks el 31 de julio de 1972. Tras varios problemas personales y laborales, además de nunca jugar ningún partido con los Chargers, finalmente lo traspasaron al entonces campeón de la NFC, Washington Redskins, a cambio de (nº 22-Mike Williams) en el draft de 1975 de la NFL y su segunda elección (nº 46-David Hill) en 1976. Con los Redskins jugó entre 1973 y 1974.
Tras una turbulenta carrera, su paso por otros varios equipos y su regreso con los Dallas Cowboys, se vio forzado a retirarse en 1979. Terminó su carrera en la NFL con 2.038 yardas de carrera, 453 acarreos y 21 touchdowns. También atrapó 38 pases para 297 yardas y 3 touchdowns.[7][8]
En 2004 fue inducido en el Salón de la Fama de Texas Black Sports.[9] Falleció el 4 de agosto de 2024 en su residencia en Amarillo, Texas a los 77 años de edad.[10]
