EcoRV
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| Identificadores | ||||
| Identificadores externos |
Bases de datos de enzimas
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| Número EC | 3.1.21 | |||
| Estructura/Función proteica | ||||
| Tipo de proteína | Hidrolasa | |||
| Funciones | Enzima | |||
| Ortólogos | ||||
| Especies |
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| Ubicación (UCSC) |
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| PubMed (Búsqueda) |
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| PMC (Búsqueda) |
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EcoRV (pronunciada "eco R cinco", número CAS 83589-02-0 , EC 3.1.21.4) es una endonucleasa de restricción tipo II aislada de ciertas cepas de Escherichia coli. Tiene el nombre alternativo de Eco32I.
En biología molecular, es una endonucleasa de uso común que crea cortes con extremos romos. La enzima reconoce la secuencia de ADN palindrómica de 6 bases: 5'-GAT | ATC-3' y hace un corte en vertical. La secuencia complementaria es 3'-CTA | TAG-5'. Los extremos son romos y pueden ser ligados a un sitio de clonación de extremo romo fácilmente, pero con menor eficacia que un extremo pegajoso.
EcoRV ha sido co-cristalizada con la secuencia que normalmente corta. Este cristal se utilizó para resolver la estructura del complejo.[1] El núcleo de la enzima se compone de cinco láminas beta flanqueadas por hélices alfa. El núcleo se conserva en todas los demás endonucleasas de restricción de tipo II. También cuenta con un subdominio de dimerización N-terminal formado por una hélice alfa corta, dos láminas beta antiparalelas, y una hélice alfa larga. Este subdominio se encuentra sólo en EcoRV y PvuII.[2]
