El edificio fue construido por el arquitecto Manuel Cifuentes[2] en 1924 por encargo de Antonio Huneeus Gana.[3] Posee una fachada ecléctica con elementos de Art Nouveau y se encuentra separada del palacio que servía de residencia de la familia Huneeus por un pasaje, actualmente denominado «Jorge Huneeus».[1]
Concebido originalmente como un «edificio de rentas» que contendría bodegas y viviendas en los pisos superiores,[4] en 1932 el edificio fue vendido y en las décadas posteriores se instalaron en él la Facultad de Educación de la Universidad Católica de Chile, una maestranza y una empresa de tecnología, entre otras.[1] En los años 1930 uno de los inquilinos del edificio fue el poeta Pablo Neruda,[5] así como también la escritora Marta Brunet.[6]
En los años 1960 el edificio fue ocupado por la Dirección de Turismo,[7][8] así como también por su sucesor, el Servicio Nacional de Turismo (Sernatur) hasta los años 1980.[9]
En 2008 el Edificio Huneeus fue adquirido por el Congreso Nacional de Chile con el fin de construir la nueva sede de la Biblioteca del Congreso Nacional,[10][11] la cual se encuentra dividida en diferentes edificios. Si bien existió un concurso de anteproyectos en 2012,[12] en el cual se anunció como ganador el 28 de enero de 2013 al proyecto encabezado por el arquitecto Alejandro Beals Vaccaro, este aún se encuentra detenido y sin obras.[13] En enero de 2020 el diputado Iván Flores propuso que la Convención Constitucional sesione en el edificio Huneeus,[14] sin embargo finalmente se decidió que dicha institución sesionara en el palacio Pereira y el palacio del ex Congreso Nacional de Chile.
El 12 de enero de 2024 se firmó un convenio entre el Senado y el Ministerio de Obras Públicas para reactivar y actualizar el proyecto de habilitación del edificio Huneeus como nueva sede de la Biblioteca del Congreso Nacional de Chile.[15]