Nació en Barranquilla, pero se crio en El Espinal (Tolima). Es abogado de la Universidad Santo Tomás, con posgrado en derecho procesal del Colegio Nuestra Señora del Rosario; profesor en la Universidad de Ibagué y la Universidad Santo Tomás. Cofundador del Nuevo Liberalismo en el Tolima. Al morir Luis Carlos Galán se unió a las filas del entonces senador liberal Mauricio Jaramillo. Es hermano de la hoy Senadora de la República por Cambio Radical Rosmery Martínez.[1]
Fue concejal del municipio de Espinal por diez años y posteriormente en 1992 diputado a la Asamblea del Tolima donde fue elegido presidente de dicha corporación.[2] Como integrante del Partido Liberal fue elegido Representante a la Cámara en las legislaturas 1994-1998 y 1998-2002, en esta última ocupó la Presidencia de esa Corporación entre el 20 de julio de 1998 y el 19 de julio de 1999.[3] Fue parte de la Comisión Primera de la Cámara.[4] Como congresista fue ponente de la reforma política de Andrés Pastrana y las reformas penal y procesal.[5]
En el año 2002 la Corte Suprema de Justicia determinó que Martínez debía responder por incurrir, en el delito de celebración indebida de contratos sin el cumplimiento de requisitos legales, cuando formó parte de la mesa directiva de la Cámara de Representantes. La Corte encontró irregularidades en la celebración de 52 millonarios contratos, dos procesos licitatorios y siete órdenes de compra entre julio de 1998 y julio de 1999.[6]
En octubre del 2000, el Consejo de Estado lo despojó de su investidura al comprobar que le otorgó un millonario contrato al tercero de su lista a la Cámara de Representantes. Además ordenó la publicación de dos libros que no tenían nada que ver con las funciones del legislativo.[6]
Fue condenado por la Corte Suprema de Justicia a 16 meses de prisión por el delito de peculado culposo con concurso homogéneo y sucesivo;[7] Martínez fue procesado por negligencia en un contrato en el que se perdieron 102 millones de pesos.[8]
La Fiscalía capturó a Emilio Martínez, dentro de un proceso que llevaba el Fiscal Sexto Especializado de Ibagué, por sus presuntos nexos con las Autodefensas Unidas de Colombia.[9] El acervo probatorio lo vinculaba con reuniones con el bloque del Tolima con el fin de garantizar protección a los candidatos a las alcaldías por su movimiento político, Cambio Radical, en Natagaima, Ataco, Rioblanco y Guamo.[10] Los miembros de las AUC aseguraron que las reuniones se llevaron a cabo en una finca llamada La Lorena, en la vereda Luisa García y Martínez habría dado 200 millones de pesos a cambio de ello.[11] Martínez siempre rechazó los señalamientos lanzados en su contra.[5]
En diciembre de 2001 cuando Martínez Rosales entraba a su vivienda del municipio de Espinal, fue víctima de un atentado, con un paquete bomba. Los hechos se registraron a las 5:30 de la tarde, después de que llegó de una manifestación pública realizada en el municipio de Prado, adonde acompañó a su hermana Rosmery Martínez, cuando era candidata a la Cámara de Representantes.[12]