Nació en el seno de una familia acaudalada integrante de la alta sociedad de Hamburgo. Hizo estudios de agronomía en la Universidad de Jena y también de filosofía y economía. En 1896 viajó a la Argentina y se radicó en la provincia de Entre Ríos,en la Mesopotamia Argentina donde practicó agricultura y ganadería durante cinco años; viajó a Hohenau, donde posteriormente compró en Trinidad un campo.[1] En 1904 viajó a lo que posteriormente fue el distrito de Capitán Meza, donde Domingo Barthe había adquirido tierra después de la Guerra contra la Triple Alianza y le compró una importante fracción de las mismas -120.000 hectáreas[2]- en la desembocadura del arroyo Yaguarazapá, un arroyo de 93 metros de altura[3] en el Río Paraná, con el dinero recibido de una herencia paterna. En 1908 Mayntzhusen describía esa tierra afirmando que “se halla cubierta con montes vírgenes y la fertilidad es incomparable con su tierra marrón obscura… cruzada por varios arroyos, nacientes y arroyuelos.”[1] y decía que el clima “es saludable y soportable para el europeo. El inmigrante nuevo, en los primeros meses del verano, sufrirá de la alta temperatura calurosa, mientras que las noches son frescas, recompensándose. Las grandes extensiones de monte influyen mucho en la normalización del clima, y las lluvias son normales. Pocas veces las lluvias en el verano tardan más de 8 a 10 días entre sí. Desde luego hay sequías, pero raras veces.”[1] Allí se podían producir desde caña de azúcar y yerba mate hasta verduras europeas, tabaco, algodón, etc.[1]
Mayntzhusen continuó mientras tanto sus investigaciones sobre la cultura y origen de los Achés Guayaki.[1] Se trata de un grupo con características culturales y dialectales propias, que pertenece a la etnia guaranizada de los achés[4] y aprendió su lengua y sus costumbres. En 1907 empezó a colonizar esas tierras vendiéndolas a pobladores alemanes, alemanes-brasileros y algunos paraguayos hasta que al estallar la Primera Guerra Mundial volvió a Alemania, se incorporó como voluntario y fue herido, por lo que viajó a Suiza, donde perfeccionó sus conocimientos de Antropología.[1]
Volvió en 1920 al Paraguay y encontró allí que había perdido todo derecho sobre sus tierras, por lo que luego de adquirir un lote prosiguió sus investigaciones dando a conocer sus resultados en Europa y en Estados Unidos.
Falleció en Paraguay el 8 de abril de 1949. Se había casado con una indígena Aché y fruto de esa relación nació su hija Silvia.[5]