Gondioque era de origen borgoñón, nieta del rey Godegisilo de Borgoña. Es brevemente mencionada en la Historia de los francos, de Gregorio de Tours.[1] En el año 517 se casó con Clodomiro, rey de Orleans. Es probable que ambos fueran padres de Guntaro, Teodebaldo y Clodoaldo (más tarde canonizado como San Clodoaldo).[2]
El rey Clodomiro encabezó una expedición contra Borgoña en el año 524 y falleció durante esta expedición, en la primavera o verano de ese mismo año, en la Batalla de Vézeronce. Sus tres hijos fueron confiados a la madre de Clodomiro, Clotilde, hasta que Gondioque se casó con Clotario I. No obstante, Clotario I, ordenó asesinar a sus hijos, aunque Clodoaldo logró escapar.[3]
El matrimonio de Clotario con Gondioque, le ofrecía a éste la oportunidad de acceder a la tesorería de Clodomiro y le aseguró a ella sus derechos como única heredera del rey Godegisel, ya que la ley franca permitía que las mujeres heredaran tierras si no tenían hijos.[1]