La iglesia de San Paolo Converso nació como iglesia del convento contiguo de la Congregación de las Hermanas Angelicales. La primera piedra del edificio se colocó en 1549 y su construcción continuó hasta 1580. Entre 1599 y 1611, el lado izquierdo, que da a la Piazza Sant'Eufemia, fue reconstruido según un diseño de Ercole Turati, mientras que la fachada actual data de 1619 y es obra de Giovan Battista Crespi, conocido como Cerano. El nuevo altar mayor, obra de Giulio Gallori y Ambrogio Pedetti, data de 1767.
En 1808, tras las supresiones conventuales de la época napoleónica, el monasterio fue desalojado, la iglesia desconsagrada y utilizada como almacén. En 1932 se llevó a cabo la restauración conservadora, dirigida por el arquitecto Mezzanotte, de todos los frescos de la sala que a partir de ese momento se utilizaría como sala para conciertos de música sacra. Dotado de una excelente acústica, sirvió como estudio de grabación de grabaciones desde principios de los años 1960, para el sello discográfico La Voce del Padre, que las vendió a Vittorio Buffoli y Giacomo Mazzini, el padre de Mina, que acababa de fundar el PDU. El renovado estudio de grabación activo desde 1970, llamado 'La Basílica', estará ubicado dentro de la iglesia hasta 1982.[1]
De 2014 a 2019 albergó la sede de Locatelli Partners, un estudio de arquitectura milanés fundado por Giovanna Cornelio, Massimiliano Locatelli y Annamaria Scevola.[2]
Desde 2016 también acoge Converso, un espacio expositivo dedicado al arte contemporáneo, también fundado por Locatelli Partners.
En 2017, el artista Asad Raza transformó parte de la iglesia en una cancha de tenis como operación artística.[3]