Después de graduarse, Joe trabajó para el Servicio de Salud Indígena y pasó tres años en el norte de Nuevo México antes de trasladarse a Dakota del Norte. Queriendo continuar su educación, Joe se mudó a California e hizo su maestría en salud pública en la Universidad de California, Berkeley.[1] Joe y Dorothy Lonewolf Miller (Blackfoot) ayudaron a la enfermera Stella Leach (Colville - Oglala Lakota), que puso en marcha la clínica de salud en la isla de Alcatraz durante la Ocupación de Alcatraz en 1969.[6] En 1971, fue una de las mujeres que constituyó el Cuerpo Nacional de Acción de Mujeres Indígenas, una organización de empoderamiento para mujeres nativas estadounidenses. Entre sus organizadores cabe mencionar a Lonewolf Miller, presidente; Grace Thorpe (Sac & Fox), vicepresidenta; Leach, segunda vicepresidenta; Woesha Cloud North (Ho-Chunk), secretaria; Henrietta Whiteman (Cheyenne), tesorera; y Joe, sargento de armas.[7]
Después de completar una segunda maestría de la UC Berkeley, en antropología, Joe trabajó cómo consultora con el Departamento de Salud del Estado de California sobre la salud indígena.[1][4] Mientras trabajaba en el Departamento de Salud de California, ayudó a fundar el primer programa frente al abuso infantil y el rechazo en la comunidad indígena urbana, lo que resultó en el establecimiento del Centro de recursos para niños indígenas urbanos de Oakland.[4] En 1976, trabajando a tiempo parcial, Joe continuó con su doctorado en antropología médica en UC Berkeley.[1] Jennie Joe Noswood leyó su tesis sobre los niños navajos con discapacidades y fue la primera navajo en obtener un doctorado de UC Berkeley.[4] Se doctoró en 1980, y trabajó como investigadora asociada para el Instituto de Análisis Científico, centrándose en cuestiones relativas a los indios americanos.[4] Joe luego fue profesora asociada en UCLA en el departamento de Antropología y Estudios Indios Americanos.[8][9]
En 1986, Joe solicitó una excedencia en UCLA para ayudar a la Universidad de Arizona a desarrollar un plan de estudios sobre discapacidades y rehabilitación para indígenas.[9] Participó en el proyecto de investigación, considerado un hito histórico en la investigación sobre las necesidades de los nativos estadounidenses, para el Departamento de Educación de los Estados Unidos. Cuando se completó el informe, A Study of the Special Problems and Needs of American Indians with Handicaps Both on and off the Reservation (Un estudio de los problemas y necesidades especiales de los indios americanos con discapacidades tanto dentro como fuera de la reserva), en 1987, ella había sido contratada como codirectora del Centro de Investigación y Capacitación de Nativos Americanos en la Universidad de Arizona.[10] En 1990, Joe enseñaba como profesora asociada y directora del Centro de Investigación y Capacitación de la universidad. Ese año fue seleccionada por la Institución Smithsonian para servir como una de los 12 miembros de la junta inaugural del Museo Nacional del Indio Americano, que se iba a construir.[11]
El trabajo de Joe como antropóloga médica consiste en evaluar la salud desde una perspectiva cultural, tratando aspectos tales como la reticencia a eliminar alimentos tradicionales de la dieta, o los tabúes con respecto al contacto físico que impiden los exámenes de los senos, entre otras prácticas, lo que puede dar lugar a que las poblaciones minoritarias reciban servicios de atención médica deficientes.[12] Entre los temas objeto de su trabajo se encuentran la diabetes, el alcoholismo y el abuso de sustancias, así como el impacto de la expulsión y reubicación forzada en las poblaciones indígenas.[9] Además de su trabajo en el Departamento de Medicina Familiar y Comunitaria, Joe es profesora en la facultad de Estudios Indígenas Estadounidenses y es miembro electo de la Sociedad de Antropología Aplicada.[13] Es miembro también del consejo de administración de la Comisión de Salud Indígena Urbana, iniciativa de la Fundación Robert Wood Johnson y del Instituto de Salud Indígena Urbano de Seattle.[13]
