Después de arbitrar dos años en la Segunda división (1975-1977) ascendió a Primera División, donde ejerció durante trece temporadas (1977/78-1989/90), dirigiendo un total de 128 partidos y arbitrando también encuentros de la Copa de Europa y de la Copa de la UEFA. Un árbitro muy polémico por la manera muy especial de interpretar el reglamento.[3]
Fue el primer colegiado en expulsar a Diego Maradona en la liga española. El jugador argentino recibió una tarjeta roja por una entrada al central Miguel Ángel en un derbi disputado entre el FC Barcelona y el RCD Espanyol jugado en el Camp Nou en la temporada 1983-84. El «Pelusa» se había cansado de recibir falta tras falta con la complacencia del colegiado hasta que tomó la justicia por su propia mano y fue cuando lo expulsó Pes Pérez.[4]
Dirigió tres clásicos -Real Madrid CF-FC Barcelona-, en 1980, 1981 y 1982. Fue el único árbitro recusado por el Real Madrid en su historia.[4]
Entre los partidos más polémicos que arbitró se encuentra el disputado en el estadio de Mestalla, entre el Valencia CF y el Sevilla CF (temporada 1985/86). El Valencia perdió por un penalti muy protestado. Pes Pérez se vio obligado a suspender varios minutos el encuentro a causa de una lluvia de almohadillas que le dificultaron abandonar el terreno de juego. Pese a que en las inmediaciones del estadio se habían congregado un millar de aficionados valencianistas que durante dos horas esperaron a Pes Pérez, el colegiado aragonés quiso abandonar el estadio por la puerta principal, aunque finalmente fue persuadido por la Policía y se retiró del campo por una puerta falsa.[5]
El colegiado, que tuvo fama de polémico, sufrió en varias ocasiones el pinchazo de las cuatro ruedas de su coche.[6]