Fue hijo del matrimonio compuesto por Vicente Ysern y María Josefa de Arce. Durante la década de 1950, ingresó a la Universidad de Salamanca, para realizar sus estudios de Teología.[2] En 1958 recibe una invitación de Eladio Vicuña Aránguiz, para establecerse en Chile junto a su hermano Juan Luis Ysern de Arce.[3] A su llegada al país, finaliza sus estudios de teología en la Universidad Católica de Chile,[2] y es ordenado sacerdote el 21 de mayo de 1961, en la Catedral de Chillán.[2]
Su primera labor como sacerdote, fue de docente en el Instituto Santa María de Chillán,[2] luego, en 1968, se titula de psicólogo en la Universidad Complutense de Madrid.[2] En 1972 retorna a Chile para trabajar como docente en la Sede Ñuble de la Universidad de Chile,[1] cual posteriormente se convierte en la Universidad del Bío-Bío, siendo parte de la Facultad de Educación y Humanidades en el Campus La Castilla,[2][4] obteniendo dicho año, la nacionalidad chilena.[1] Tras realizar un máster de Psicología en Lovaina, Bélgica, retorna a la misma universidad fundado la Escuela de Psicología de la institución universitaria en el Campus Fernando May,[2] cual además contaría con la creación de un centro psicosocial en la ciudad de Chillán.[5]
Durante la dictadura militar, se desempeñó como capellán de la Cárcel de Chillán,[2] colaborando con las víctimas y familiares de Violaciones de los derechos humanos, donde su mayor aporte fue en ayuda a los familiares de los asesinados del Puente El Ala,[2] obra que posteriormente sería reconocida por diversas instituciones dedicadas a la preservación de la memoria de las víctimas de la dictadura.[1] Más tarde, entre 1985 y 1992 fue rector de Seminario Metropolitano de Concepción.[1] Al año siguiente realiza un doctorado en Psicología en Salamanca, España.[1]
Los últimos años de José Luis Ysern, se desempeñaron como constante colaborador en la Radio El Sembrador y el periódico La Discusión.[1][6] También se desempeña como rector del Seminario de Concepción.[6] Para 2013, es declarado profesor emérito de la Universidad del Bío-Bío.[2][1] Fue reconocido en 2018 con la medalla Intendente Vicente Méndez, entregado por la Gobernación provincial de Ñuble en su último periodo.[1]
Las últimas labores de Ysern, fueron como sacerdote en la Catedral de Chillán y la Capilla Espíritu Santo de la Parroquia El Buen Pastor del sector de Los Volcanes de Chillán.[4] Falleció en la madrugada del 15 de agosto de 2021 en la ciudad de Chillán,[2] sus restos fueron sepultados en el Cementerio Municipal de Chillán. Actualmente el centro psicosocial lleva el nombre de José Luis Ysern de Arce.[1]
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