Se conoce la existencia del asentamiento en documentos desde 1618, cuando era un miasteczko ubicado en la vólost de Mýrhorod de la República de las Dos Naciones. En aquel momento era un señorío de Jeremi Wiśniowiecki, hasta que en 1630 fue ocupado temporalmente por el realengo para extraer salitre, debido a las necesidades militares de fabricación de pólvora. Jeremi Wiśniowiecki recuperó las tierras en 1647, pero al año siguiente estalló la rebelión de Jmelnitski. Debido a la rebelión, Komyshniá pasó a organizarse como la sede de una sotnia, que quedó integrada durante un siglo en el regimiento cosaco de Hádiach, aunque en sus primeros años formó parte del regimiento de Mýrhorod.[4][5]
En 1781 pasó a formar parte del uyezd de Mýrhorod, que desde 1802 quedó integrado en la gobernación de Poltava. En aquella época tenía más de tres mil habitantes, y desde 1797 era sede de su propia vólost. En 1812, durante la invasión napoleónica de Rusia, se creó aquí un regimiento cosaco que luchó contra la Grande Armée en Kaluga, Yújnov, Krasny y Zamość; la bandera del regimiento quedó depositada en 1816 en una iglesia de Komyshniá. Al finalizar el siglo XIX tenía ya casi siete mil habitantes.[6][7]
La RSS de Ucrania le dio el estatus de capital de su propio raión en 1923, y en los años siguientes se intentó organizar la economía local en granjas colectivas, aunque hubo dificultades organizativas para ello, al mantenerse una economía rural en un asentamiento tan poblado. En respuesta a la oposición a la colectivización, Komyshniá fue una de las localidades de la región más afectadas por la deskulakización y el Holodomor, hasta el punto de que perdió dos mil habitantes en pocos años, y entre 1931 y 1935 pasó a formar parte del raión de Mýrhorod. En la Segunda Guerra Mundial fue zona de combates, con medio millar de muertos en la población local. Aunque en 1957 adoptó el estatus de asentamiento de tipo urbano, en 1962 perdió definitivamente su estatus de capital de raión, y desde entonces está en una situación de progresivo declive económico y demográfico.[8][9]