Cada emparejamiento en la fase eliminatoria, aparte de la final, se juega a dos partidos, con cada equipo jugando un partido en casa. El equipo que anota más goles en el conjunto avanza a la siguiente ronda. Si el empate persiste, se aplica la regla del gol de visitante, es decir, el equipo que anota más goles fuera de casa avanza. Si los goles de visitante también son iguales, entonces se juega una prórroga. La regla del gol de visitante se aplica de nuevo después de dicha prórroga, es decir, si hay goles marcados durante el tiempo adicional y sigue el empate, el equipo visitante avanza en virtud de más goles marcados. Si no se marcan goles durante el tiempo extra, el empate se decide mediante una tanda de tiros desde el punto penal. En la final, que se juega a un solo partido, si hay empate al final del tiempo normal, se juega una prórroga, seguido de una tanda de tiros desde el punto penal si la final permanece empatada.[61]
El mecanismo de los sorteos para cada ronda es el siguiente:
- En el sorteo de los dieciseisavos de final, se divide a los equipos en dos grupos, el de cabezas de serie (consistente en el campeón vigente y los otros 15 mejores equipos según el coeficiente UEFA) y el de no cabezas de serie (consistente en los otros 16 equipos). Los cabezas de serie son emparejados con los no cabezas de serie pero los equipos de la misma asociación o los que vengan del mismo grupo de la fase de clasificación no pueden ser emparejados. Los cabezas de serie juegan el partido de vuelta en casa.
- En el sorteo de la ronda 16, se divide a los equipos en dos grupos, el de cabezas de serie (consistente en los 8 mejores equipos según el coeficiente UEFA) y el de no cabezas de serie (consistente en los otros 8 equipos). Los cabezas de serie son emparejados con los no cabezas de serie pero los equipos de la misma asociación o los que vengan del mismo grupo de la fase de clasificación no pueden ser emparejados. Cuál partido es jugado como local y cuál como visitante es elegido por sorteo.
- En los sorteos para los cuartos de final y las semifinales, no tiene restricciones. Los equipos que salen primero en sus enfrentamientos disputan el partido de ida en casa. También se realiza un sorteo para determinar qué ganador de la semifinal se designa como el equipo "local" para la final (para fines administrativos, ya que se juega en un lugar neutral).
El sorteo para los dieciseisavos de final se celebró el 17 de agosto de 2018, a las 14:00 CEST, en la sede de la UEFA en Nyon, Suiza.[62] Los partidos de ida se jugaron los días 12 y 13 de septiembre, y las vueltas los días 26 y 27 de septiembre de 2018.
El sorteo de los octavos de final se celebró el 1 de octubre de 2018, a las 13:00 CEST, en la sede de la UEFA en Nyon, Suiza.[63] Los partidos de ida se jugaron el 17 y 18 de octubre, y las vueltas el 31 de octubre y el 1 de noviembre de 2018.
El sorteo los cuartos de final se celebró el 9 de noviembre de 2018, a las 13:00 CEST, en la sede de la UEFA en Nyon, Suiza.[64] Los partidos de ida se jugaron el 20 y 21 de marzo, y las vueltas el 27 de marzo de 2019.
El sorteo las semifinales se celebró el 9 de noviembre de 2018, a las 13:00 CEST, después del sorteo de cuartos de final, en la sede de la UEFA en Nyon, Suiza.[64] Los partidos de ida se jugaron el 21 de abril, y las vueltas el 28 de abril de 2019.
La final se jugó el 18 de mayo de 2019 en el Groupama Arena en Budapest. El equipo "local" para la final (para fines administrativos) se determinó mediante un sorteo adicional realizado después de los sorteos de cuartos de final y semifinales.[64]