Debido a los crecidos gastos que había provocado la Guerra de Sucesión de Austria, la corona española designó varios títulos nobiliarios en blanco a los virreyes de tierras americanas, para que estos los vendiesen libres de impuestos y por la cantidad que estimaren conveniente al mejor postor. Es de esta manera que el ambateño Antonio Flores y de Vergara compró uno por 22.000 pesos al virrey del Perú, José Antonio Manso de Velasco, negociando para sí la denominación de marqués de Miraflores que le fue confirmada por la corona el 31 de marzo de 1751.[2] El mayorazgo que acompañaría al marquesado fue creado ocho meses después, mediante Real Cédula emitida por el rey Fernando VI el 24 de noviembre del mismo año.[2]
En 1810 Antonia Paula Flores de Vergara y Carrión, III marquesa de Miraflores, renunció al título en favor de su primogénito Pedro Quiñones de Cienfuegos y Flores de Vergara, a quien la corona revocó el título en 1815 debido a la fuerte militancia independentista que la familia había demostrado durante el proceso revolucionario quiteño que tuvo lugar entre 1809 y 1812, por lo que el título quedó vacante.
Posteriormente, el 28 de agosto de 1817, el rey Fernando VII creó el marquesado de Miraflores a favor de Carlos Francisco Pando y Álava, sin ninguna relación entre ambos títulos, salvo tener durante mucho tiempo la misma denominación.
El título otorgado en 1751 se rehabilitó en 1984 en la persona de María del Pilar Salgado Tovar, siendo sustituida la denominación original por la actual de Miraflores de San Antonio el 25 de enero de 1985. La rehabilitación del marquesado se dio en favor de una figura con un entronque falso con la bisabuela del concesionario original, a pesar de existir descendientes directos de don Antonio Flores de Vergara hasta el día de hoy en las repúblicas de Ecuador y Bolivia.[3]
