NAMD
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NAMD (Not (just) Another Molecular Dynamics program)[1] es un software para dinámica molecular en paralelo diseñado para simulaciones de alto desempeño de sistemas biomoleculares. Se hizo acreedor de un premio Gordon Bell en 2002.[2] Está basado en objetos paralelos Charm++ y es escalable a cientos de procesadores en plataformas de punta y decenas de procesadores en cómodos clusters usando ethernet gigabit. NAMD usa el popular programa de presentación gráfica molecular VMD para configurar la simulación y analizar las trayectorias, siendo también parcialmente compatible con AMBER, CHARMM y X-PLOR.
Desarrollador
Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) y The Parallel Programming Laboratory (PPL)
Licencia
University of Illinois license
Estado actual
Con soporte
| NAMD | ||
|---|---|---|
| Información general | ||
| Tipo de programa | Dinámica molecular | |
| Desarrollador | Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) y The Parallel Programming Laboratory (PPL) | |
| Licencia | University of Illinois license | |
| Estado actual | Con soporte | |
| Idiomas | 1 | |
| Información técnica | ||
| Programado en | C++ | |
| Plataformas admitidas | «x86», «x86-64» | |
| Versiones | ||
| Última versión estable | 2.9 (info) (30 de abril de 2012 (13 años, 10 meses y 14 días)) | |
| Archivos legibles | ||
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| Enlaces | ||
Véase también
- Dinámica molecular
- CHARMM
- GROMACS
- AMBER
