Omer nació en Gjirokastra, en la Vilayet de Janina del Imperio Otomano. Su hermano, Beso, era profesor, entre cuyos alumnos se encontraba el joven Enver Hoxha (también natural de Gjirokastra).[1] Nishani estudió medicina en Estambul, graduándose, pero sin ejercerla.[2] Trabajó como médico en Viena y, de 1915 a 1918, en Ballsh. Se trasladó a Tirana, al Hospital de Tirana, y luego a Durrës hasta 1924.[3]
A principios de la década de 1920 se involucró en la política. Participó en un intento de asesinato contra Ahmet Zogu en 1924 y cumplió dos semanas de prisión.[3] Más tarde, apoyó la Revolución de junio de Fan S. Noli cuyas fuerzas en 1924 derrocaron el orden conservador respaldado por Ahmet Zogu y establecieron un gobierno democrático. Nishani participó en un juicio celebrado contra Zogu in absentia.[4] Después de la caída del gobierno en diciembre de ese mismo año, Nishani huyó al extranjero y cofundó el KONARE (Comité Nacional Revolucionario) anti-Zogu y respaldado por la Comintern en 1925, ayudando a dirigir su periódico Liria Kombëtare (Libertad Nacional) junto con el comunista albanés Halim Xhelo de 1925 a 1932 en Ginebra.[5] Se estableció en Viena y se casó con una austriaca, Rozvita von Woler. Mientras estaba en el exilio, fue condenado a muerte en Albania.[3]
Después de la invasión italiana de Albania en 1939, Nishani regresó al país y se unió inicialmente al Consejo de Estado del gobierno colaboracionista, que comprendía varias personalidades opuestas al rey Zog.[6] Nishani, quien había conocido al padre de Enver Hoxha, Halil, recibió la visita de Hoxha (quien entonces dirigía el Partido Comunista de Albania y lideraba la resistencia partisana) y comentó: «Los viejos, ya hemos tenido nuestra oportunidad. ¡Viva la juventud!, porque son la esperanza del país. No he hecho gran cosa, pero luché contra Zog con todas mis fuerzas. Y tuve buenos compañeros en el periódico que me ayudaron en ese sentido. No me rendí, pero ¿qué iba a hacer, morir en el exilio? Anhelaba ver el país y a mi gente. Regresé, pero a estos fascistas, ocupantes y a todos los canallas que les sirven como perros, los odio con locura. Pero dirás, ¿por qué te uniste al 'Consejo de Estado'? Tuve que hacerlo, porque no tengo nada para vivir y tengo una esposa que mantener. Así que a esto me he visto reducido».[7] Rápidamente se desilusionó con la ocupación posterior a Zog y consideró un error su participación en el gobierno colaboracionista ; en esta misma conversación, dijo: «Todo el mundo sabe que el fascismo les corta la cabeza a los comunistas. No soy comunista, pero he vivido y trabajado con ellos, los he respetado y ellos me han respetado. Les diré una cosa: para ustedes el camino no está sembrado de flores, pero sigan adelante, luchen, porque solo luchando salvarán a Albania».[8]
Tras convencer a Nishani de involucrarse en lo que los comunistas denominaban la Guerra Antifascista de Liberación Nacional, Hoxha señaló: «Omer Nishani cumplió su palabra y trabajó en Tirana como un ferviente activista del Movimiento de Liberación Nacional. Y cuando la situación lo requería, los camaradas y yo lo conversábamos y pensábamos que sería valioso para el Consejo General como hombre maduro, patriota y culto en la labor de propaganda, la organización del Estado, etc. Le enviamos un mensaje y el médico partió de Tirana rumbo a las montañas, donde permaneció hasta la liberación del país».[9] Nishani se convirtió en miembro del Movimiento de Liberación Nacional tras su formación en septiembre de 1942.[10] En septiembre de 1943, Nishani fue nombrado Presidente del Comité Permanente del Consejo General de Liberación Nacional,[11] y en el Congreso de Përmet en mayo de 1944 fue nombrado Presidente del Consejo Antifascista de Liberación Nacional y encargado de asuntos exteriores.[12][13] El 11 de enero de 1946, Nishani fue elegido presidente de la Asamblea Constituyente que el 16 de marzo se transformó en la Asamblea Popular de la República Popular de Albania.[14]
Nishani, que no era miembro del gobernante Partido del Trabajo de Albania,[15] fue el primer presidente del Presidium de la Asamblea Popular.[16]
En 1952, su hermano, Besim Nishani, fue arrestado por “propaganda contra el gobierno popular”.[17] Al mismo tiempo, se dice que su esposa se separó de él. Algunos informes citaron que este era su deseo de separarse.[3] Un artículo de 1953 en el periódico derechista Paris-Presse sugería que su esposa (a quien el periódico se refería como israelí) fue obligada a abandonar el palacio presidencial y vivir bajo arresto domiciliario bajo sospecha de tener vínculos con elementos reaccionarios, y que el propio Nishani era prácticamente un prisionero.[18]
Oficialmente, Nishani solicitó su dimisión el 24 de julio de 1953 por razones de salud.[16] Fue sucedido por Haxhi Lleshi el 1 de agosto.[19]
Según un expediente del Ministerio del Interior de Albania, la autopsia del cuerpo de Nishani concluyó que se había suicidado, algo considerado tabú en aquella época.[20][21] Sin embargo, informes posteriores sugieren que recibió dos disparos en el pecho y cuestionaron la conclusión del suicidio.[22]
En 1988 se publicó una compilación de sus artículos y discursos pronunciados durante el período socialista bajo el título Por la Albania del Pueblo.
Era un pariente lejano del séptimo presidente de Albania, Bujar Nishani.[23]