El primer año de Le Jeune lo pasó en los asentamientos franceses. Conocido por su trabajo con la población de Primeras Naciones, Le Jeune mostró un entusiasmo por aprender varios idiomas nativos americanos. Su tarea era traducir la Biblia,[5] concentrar a los indígenas en asentamientos permanentes y educarles en la manera de vivir de los europeos.[6] Entre sus experiencias mejor documentadas se encuentran sus viajes durante el invierno de 1633-1634 entre los Montagnais.[4] Durante el viaje tuvo que lidiar con las burlas y la hostilidad ocasional del chamán Carigonan. Si bien su trabajo durante esos seis meses no resultó en conversiones masivas como esperaba, su relato etnográfico de los Montagnais y sus anécdotas personales sobre el frío, el hambre y los conflictos que encontró están registrados en Relations des Jésuites de la Nouvelle-France de 1634. EFK Koemer sugiere que la identificación de Le Jeune de una distinción entre sustantivos animados e inanimados finalmente ayudó a John Eliot en su gramática de la lengua Natick.[7]
Le Jeune decidió que para llevar a cabo eficazmente su apostolado, necesitaba establecer asentamientos misioneros, siguiendo el modelo de la obra misional jesuita en San Ignacio Miní en Misiones Argentina y la región fronteriza de Paraguay, un hospital para atender a los ancianos y enfermos. y escuelas para la educación de los jóvenes. [4] Escribió que "estos bárbaros cuerpos bien formados y órganos bien regulados y bien organizados, sus mentes deberían trabajar con facilidad. Educación y sólo falta instrucción." [8] Le Jeune animó a sus misioneros a aprender las lenguas nativas.[3] En 1634 envió al padre Jacques Buteux al puesto comercial de Trois-Rivières para instruir a los indígenas que lo utilizaban como lugar de paso de verano.[9]
En 1635 se estableció en Quebec un colegio jesuita para educar a niños franceses y amerindios,[10] con Antoine Daniel a cargo. El mismo cerró después de cinco años. Ese diciembre, Le Jeune predicó el sermón en el funeral de Samuel de Champlain, quien había llegado a la región a comienzos de 1600.
En 1637,[11] puso los cimientos de una casa para misioneros en Sillery, que lleva el nombre del benefactor Noël Brûlart de Sillery, quien proporcionó los fondos.
Le Jeune descubrió que las imágenes devocionales le ayudaban mucho a transmitir las ideas que intentaba expresar. [12] Las procesiones religiosas tenían una importante función cívica. Le Jeune registró una celebración celebrada en Quebec en 1639 en honor al nacimiento de Luis XIV. Además de fuegos artificiales y salvas de cañón, se celebró una procesión coincidiendo con la Fiesta de la Asunción, en la que los franceses y más de un centenar de indios, seis de ellos vestidos con suntuosos trajes reales franceses, procedieron desde el hospital hasta el convento de las Ursulinas, y finalmente a la iglesia de los jesuitas. Se ofrecieron resos tanto en francés como en el idioma indio local, y cuando terminó la procesión, el Gobernador ofreció un banquete para todos los asistentes. La procesión se había convertido en una pieza central de la frágil comunidad multicultural.[13] En 1639 había menos de 100 conversos entre los hurones, que eran varios miles. [5]
Le Jeune y sus contemporáneos no limitaron sus esfuerzos de conversión y educación a los nativos americanos. Si bien había menos esclavos en las colonias francesas que en las inglesas y españolas, las interacciones de Le Jeune con los esclavos africanos en Quebec sentaron un precedente clave que inspiraría a generaciones posteriores de sacerdotes, maestros, activistas y abolicionistas. La práctica jesuita consideraba que todas las personas eran iguales ante Dios y tenían la misma necesidad de salvación. Por tanto, correspondía a la Iglesia velar por el bienestar intelectual y espiritual de los esclavos. El propio Le Jeune adoptó un enfoque muy directo sobre esta cuestión. Ya en 1634, Le Jeune expresó entusiasmo porque se encontraba enseñando el alfabeto a niños africanos, y en el Volumen V de The Jesuit Relations enfatizó la necesidad de que los africanos obtuvieran suficiente aprendizaje y alfabetización para que pudieran demostrar una comprensión suficiente del idioma católico. dogma para asegurar el rito del bautismo.
Dado que los jesuitas enfatizaron constantemente el papel del intelecto, defendieron la educación de los esclavos en todas las colonias. La mayor parte del trabajo de los sacerdotes era con niños esclavos; a diferencia de los adultos, se les concedió tiempo lejos de sus amos para recibir educación básica y, dado que ya se habían producido tantas perturbaciones culturales, los padres esclavos no solían estar en oposición a la educación de la misma manera que lo eran los padres nativos americanos.
En su trabajo con los hijos de colonos, esclavos y nativos americanos, Le Jeune y sus compañeros jesuitas utilizaron el mismo tipo de materiales, como una cartilla o un libro de cuernos, que se utilizaron en todas las colonias de América del Norte. Estos materiales transmitían creencias culturales y religiosas tradicionales europeas y al mismo tiempo fomentaban la alfabetización. Los jesuitas sostenían que enseñar el catecismo, pasajes bíblicos e historias religiosas era la función principal de la alfabetización en Nueva Francia .
Estableció la capilla de Notre Dame de Recouvrance en Quebec y le asignó a los padres Charles Lallemant y Anne de Nouë a servir como sus sacerdotes. En agosto de 1639 sor María de la Encarnación llega a Quebec. Las Ursulinas fundaron un convento en la ciudad baja (Basse-Ville).[14] También estaban a bordo tres canonesas de San Agustín de la Misericordia de Jesús para establecer un hospital financiado por la sobrina del cardenal Richelieu, Marie Madeleine d'Aiguillon, en respuesta a un informe escrito por Le Jeune y que había sido publicado en la prensa Relaciones en Francia.
Le Jeune siguió siendo Superior de la misión jesuita hasta 1639, cuando fue relevado por el padre Barthélemy Vimont, pero no regresó a Francia sino hasta 1649. A su regreso, se desempeñó como procurador de la misión de Nueva Francia hasta 1662, sólo dos años antes de su muerte.