La comuna fue creada mediante Decreto 792 del 28 de febrero de 1919, el cual también creó la 14.a subdelegación «Tres Esteros» en el departamento de Osorno, a partir de la 5.a subdelegación Rahue.[1] La nueva comuna quedó integrada por las subdelegaciones Rahue (5.a modificada), San Juan de la Costa (7.a) y Tres Esteros (14.a).
En 1920, según el censo de ese año, la comuna tenía 12 866 habitantes, con el 14,8 % del total viviendo en zona urbana (el distrito Rahue).[2]
Sin embargo, en el año 1927, durante el gobierno del presidente Carlos Ibáñez del Campo, se realizó una nueva división administrativa del país, suprimiéndose la comuna de Rahue y traspasándose el departamento de Osorno a la provincia de Valdivia.[3] Las razones que se esgrimieron fueron la insolvencia económica de la zona, ya que esta generaba pocos ingresos, además de la necesidad de crear una modernización territorial más eficiente.[4] Las subdelegaciones 5.a y 7.a fueron anexadas a la comuna de Osorno, mientras que la 14.a subdelegación se traspasó a la comuna de Río Negro.[3] La supresión se hizo afectiva a contar del 1 de febrero de 1928.