Hernando comenzó su carrera como entrenador en equipos de formación del Málaga CF, donde estuvo trabajando desde 2009 hasta 2013, además es maestro de educación física y licenciado en ciencias de la Actividad Física y del Deporte, además posee un master en Psicología del deporte.
Tras trabajar en diversos proyectos con el fútbol base en Dubái de 2014 a 2016, de julio hasta diciembre de 2016, fue entrenador del Ulaanbaatar City FC, un club de la primera división que solo tenía un año de vida.[1]
Durante la temporada 2016-17, trabajó en el Estoril Praia SAD de la primera división portuguesa donde ejerció como segundo entrenador de Pedro Gómez Carmona. Y en SJK Seinäjoki de la Veikkausliiga finlandesa.
El 23 de octubre de 2017 se convierte en entrenador de la Peña Sport FC de la Segunda División B de España para hacerse cargo del equipo tras la destitución de David Ruiz, tras los malos resultados del comienzo de la temporada 2017-18. Cogió el timón del equipo en la jornada 12, cuando todavía no había conseguido ningún punto, y mantuvo al equipo con vida hasta la penúltima jornada de Liga, no pudiendo evitar el descenso a Tercera División.[2]
El 12 de junio de 2018, firma con el Club Deportivo Izarra de la Segunda División B de España.[3]
El 12 de marzo de 2019 es destituido del cargo.[4]
El 10 de junio de 2021, firma por el Racing Rioja C. F. de la Segunda División RFEF.[5]
El 14 de enero de 2022, sería destituido del conjunto riojano debido a los malos resultados en los últimos partidos.[6]
El 14 de marzo de 2023, firma por el C. D. Izarra de la Segunda División RFEF.[7]
