Este género contiene las siguientes especies y subespecies:
- Zapus hudsonius
- Zapus hudsonius acadicus
- Zapus hudsonius adamsi
- Zapus hudsonius alascensis
- Zapus hudsonius americanus
- Zapus hudsonius campestris
- Zapus hudsonius canadensis
- Zapus hudsonius hudsonius
- Zapus hudsonius preblei
- Zapus hudsonius transitionalis
- Zapus princeps
- Zapus princeps chysogenys
- Zapus princeps cinereus
- Zapus princeps curtatus
- Zapus princeps idahoensis
- Zapus princeps kootenayensis
- Zapus princeps minor
- Zapus princeps oregonus
- Zapus princeps pacificus
- Zapus princeps princeps
- Zapus princeps saltator
- Zapus princeps utahensis
- Zapus trinotatus
- Zapus trinotatus eureka
- Zapus trinotatus montanus
- Zapus trinotatus orarius
- Zapus trinotatus trinotatus
También se conocen varias especies de fósiles, siendo Zapus rinkeri la más antigua.[2]
