Angarietis regresó a Lituania. Su familia no aprobaba sus actividades revolucionarias y él rompió todos sus lazos con ellos después de que los obreros de la finca de su padre se pusieran en huelga y su padre llamase a la policía para reprimir la protesta.[2] Angarietis se unió al Partido Socialdemócrata de Lituania en 1906 y fue elegido miembro de su Comité Central en 1907.[1] En 1908-1909, organizó la publicación del periódico ilegal Darbininkų žodis (La Voz de los Trabajadores) en Marijampolė. Por ello fue detenido en 1909 y condenado a cuatro años de prisión en 1911. Durante su arresto y juicio fue encarcelado en Suwałki, donde tuvo acceso a una biblioteca y podía escribir. Al menos dos de sus obras, Ateities surėdymas (Construyendo el futuro) y Materialistiškasis istorijos supratimas (La comprensión materialista de la historia) fueron escritas allí y sacadas clandestinamente de la prisión, siendo publicadas posteriormente en los Estados Unidos. En octubre de 1911 fue trasladado a Pskov, donde las condiciones de vida eran considerablemente peores. Hasta su liberación en 1915 estuvo deportado en Minusinsk, en la Gubernia de Yeniseysk.[2]
Tras el fracaso de establecer el régimen comunista en Lituania, Angarietis se retiró a Rusia para no volver jamás a su país de origen. Primero vivió en Smolensk (1920-1922) y después en Moscú. En 1921, escribió un manuscrito de 480 páginas sobre la historia del Partido Comunista de Lituania y acusó a Kapsukas de muchos errores ideológicos y prácticos que llevaron a su fracaso. Este conflicto fue rápidamente detenido por los líderes comunistas rusos.[2]
Angarietis permaneció implicado en el Partido Comunista de Lituania, supervisando sus actividades clandestinas y dirigiendo su prensa desde Smolensk. Escribió numerosos libros, ensayos y panfletos. También editó una colección de obras escogidas de Lenin en dieciocho volúmenes. Fue editor de varios periódicos, incluyendo Komunistas (El Comunista, 1918-1939), Kibirkštis (La Chispa, 1924-1926), Balsas (La Voz, 1929-1933), Partijos darbas (El Trabajo del Partido, 1931-1933). También dio clases en la Universidad Comunista de Minorías Nacionales del Oeste.[2] Angarietis fue representante del Partido Comunista de Lituania en la Comintern. Fue delegado a los congresos 3.º, 4.º, 5.º, 6.º y 7.º de la Internacional Comunista. Durante los congresos 5.º, 6.º y 7.º fue elegido miembro de la Comisión Internacional de Control, de la cual fue secretario entre 1926 y 1935.[3] También fue delegado al VI Congreso del Partido Obrero Socialdemócrata de Rusia y a los congresos del Partido Comunista Ruso 8.º, 10.º y 12.º-17º.[3]
