Fue hijo del matrimonio formado por Íñigo López de Mendoza (1438-1500), III duque del Infantado; y María de Luna y Pimentel (m. 1505). Tuvo varios hermanos y hermanas:
- Diego Hurtado de Mendoza de la Vega y Luna (Arenas de San Pedro, 11 de marzo de 1461-Guadalajara, 30 de agosto de 1531)[1] que sucedió a su padre en todos sus títulos.
- Brianda de Mendoza y Luna (-1534)[3] que fue monja en el convento de la Piedad en Guadalajara.[1]
- Francisca de Mendoza y Luna (-a. 1505),[5] casada con Luis de la Cerda y Castro (m. 1502), II señor de Mandayona y Miedes,[1] hijo de Íñigo López de la Cerda y de la Vega (-1501) señor de Miedes y de Atienza, y de su esposa, Brianda de Castro, I señora de Mandayona.[1] Tuvieron una hija, Brianda de la Cerda y Mendoza casada con Diego Gómez Sarmiento de Villandrando y Ulloa, III conde de Salinas y III conde de Ribadeo.[1]
- Bernardino de Mendoza y Luna, archidiácono de Guadalajara en la catedral de Toledo.[1]
Casó en primeras nupcias con Leonor Castilla de Albornoz.[1]
Contrajo un segundo matrimonio con Teresa Carrillo de Castilla, hija de Alfonso Carrillo de Acuña[6] y de su esposa Leonor de Toledo.[6] De este segundo matrimonio tuvo un hijo, Pedro González de Mendoza que, en 1525, contrajo matrimonio con Isabel Ruiz de Alarcón, hija de Hernando de Alarcón; con descendencia.
Murió hacia 1510.
