Fue uno de los hijos del matrimonio formado por Pedro González de Mendoza, IV señor de la Torre de Esteban Hambrán; y su esposa, Isabel Ruiz de Alarcón, II marquesa de la Valle Siciliana.[2] Álvaro tuvo otros hermanos:
- Fernando de Alarcón, casado con Leonor Sanseverino, hija de Pedro Antonio, príncipe de Bisignano y de su esposa Luisa Orsini. Fernando murió en su juventud, antes de la muerte de su madre. Fernando tuvo descendencia de su matrimonio con Leonor Sanseverino.
- Juan de Mendoza, que sucedió a su padre como castellano de Castel Nuovo y después ingresó en la Compañía de Jesús.[3]
- Rodrigo de Mendoza, casado con Dianora [Eleonora] Sanseverino. Fue caballero de la orden de Santiago y gobernador de los Tercios de Nápoles.
- Diego de Alarcón y Mendoza, fue primero eclesiástico y prior de San Nicolás de Bari; y después, capitán de infantería. Contrajo matrimonio con Claudia de Caro, natural de Cosenza.
- Ana de Mendoza, casada en primeras nupcias con Lelio Carafa, marqués de Arienzo, sin descendencia; y en segundas nupcias con Carlo Caracciolo, conde de Sant’Angelo dei Lombardi, con descendencia.[4]
- Catalina de Mendoza, casada con Lorenzo Papacoda, marqués de Capurto, con descendencia.
- Francesco, casado con Vittoria Brancaccio.
Fue gentilhombre del futuro Felipe II, cuando este fue rey consorte de Inglaterra por su matrimonio con María Tudor entre 1554 y 1556.
Este último año sucedió a su hermano mayor Juan como castellano del Castel Nuovo de Nápoles debido a su ingresó en la Compañía de Jesús.
El año siguiente participó en la batalla de San Quintín.
Contrajo matrimonio con Ana de Toledo, hija de Pedro de Toledo, que fue virrey de Nápoles; y de su esposa María Osorio Pimentel, II marquesa de Villafranca del Bierzo.
Fue miembro del Consejo Colateral del reino de Nápoles, órgano supremo del reino. También fue comendador de la Mestanza en la orden de Calatrava.