Dans le Bach Compendium, les œuvres sont réparties selon les groupes suivants:
- A – Cantates pour les dimanches et jours fériés de l'année ecclésiastique
- B – Pièces sacrées pour des manifestations particulières
- C – Motets
- D – Passions et oratorios
- E – Musique d'église en latin
- F – Chants chorals et spirituels
- G – Cantates pour la cour, la noblesse et la bourgeoisie
- H – Musique de chambre vocale
Ce groupe est composé de seulement trois œuvres: Quodlibet (BWV 524, BC-H1), Aria „Sooft ich meine Tobacks-Pfeife“ (BWV 515, BC-H2) et Murky „Ihr Schönen höret an“ (BWV Anh. 40, BC-H3).
- I – Œuvres libres pour orgue
- K – Œuvres pour orgue et chœurs
- L – Œuvres pour clavier
- M – Musique de chambre pour instrument soliste
- N – Musique de chambre pour duo ou trio
- O – Musique de chambre pour plus grand ensemble
- P – Canons
- Q – Œuvres destinées à l'enseignement ou à l'apprentissage
- R – Esquisses et projets
- S – Recueils originaux
- T – Œuvres vocales douteuses
- U – Œuvres instrumentales douteuses
- V – Œuvres vocales attribuées par erreur
- W – Œuvres instrumentales attribuées par erreur
- X – Copies (y compris avec des modifications mineures) d'œuvres vocales composées par d'autres
- Y – Copies (y compris avec des modifications mineures) d'œuvres instrumentales composées par d'autres
- Z – Recueils contemporains de Bach
