En 1593, le couple eut une fille, Ana María de Loyola Coya, née au Chili après que Martín García Óñez de Loyola en fut nommé gouverneur. Celui-ci meurt assassiné en 1598 lors de la bataille de Curalaba contre les Mapuches.
Avec sa fille, Beatriz retourna au Pérou avec l'intention de partir pour l'Espagne. Mais elle trouva la mort le à Lima[2].