Après avoir longtemps été membre de la CDU[2], il participe en 2012 à la création du mouvement anti-euro Alternative pour l'Allemagne (AfD), un nom choisi en réponse aux propos de la chancelière Angela Merkel. L'AfD se transforme en parti politique[3] et Bernd Lucke devient l'un de ses trois porte-parole, élu lors du congrès fondateur qui a lieu le à Berlin[4].
Cofondateur de l'Alternative électorale 2013, il s'inquiète de «l'ignorance des électeurs en matière d'économie»[5].
En , critiqué pour son autoritarisme[2], il décide de quitter l'AfD à la suite de l'élection de Frauke Petry à la tête du parti[6]. Il fonde le parti Réformateur libéral-conservateur (LKR) dont il est président jusqu'en et à nouveau de à .
Il est tête de liste lors des élections européennes de mai 2019, mais le parti ne recueille que 0,1% des voix et il perd son siège de député européen.
Après avoir été suspendu par l'université de Hambourg de 2014 à 2019 en raison de son mandat au Parlement européen, Bernd Lucke reprend ses activités d'enseignant à l'hiver 2019. Certains étudiants de gauche s'y opposent, l'accusant d'être responsable de la montée de l'extrême droite en Allemagne et de défendre un modèle néo-libéral. L'enseignant réfute ces accusations mais ne peut pas assurer ses premiers cours magistraux en raison de perturbations causées par ces étudiants[7]. Le président fédéral, Frank-Walter Steinmeier (SPD), prend sa défense en déclarant qu'il est inacceptable de vouloir faire taire les autres en raison de divergences d'opinions[8].
↑(de) Tilman Steffen et AFP, «Frank-Walter Steinmeier: Bundespräsident kritisiert Umgang mit Bernd Lucke», Die Zeit, (ISSN0044-2070, lire en ligne, consulté le )