Breach 2 est un jeu de tactique au tour par tour qui met le joueur aux commandes d’une escouade futuriste lors d’une variété de missions[3]. Il peut se jouer entièrement à la souris, ou avec le clavier. Le joueur doit d’abord configurer son chef d’escouade puis sélectionner une mission parmi la douzaine proposée dans le jeu. Ces missions impliquent généralement de remplir un objectif, comme secourir un officier, traverser un fleuve ou éliminer un assassin extraterrestre. Outre les missions prédéfinies, le jeu inclut un éditeur de scénario qui permet au joueur de créer ses propres missions puis de les essayer[4]. Chaque mission débute dans le vaisseau du joueur où il peut déplacer ses hommes individuellement et récupérer de l’équipement supplémentaire pour son leader. Le joueur peut ensuite ordonner à son escouade de sortir du vaisseau, si celui-ci a atterri, ou de se téléporter dans la zone d’intervention[3]. Le joueur contrôle ensuite ses soldats chacun à leur tour, en commençant par son leader. En dépensant des points d’actions, le joueur peut leur faire réaliser différentes actions comme se déplacer, ouvrir une porte, ramasser ou utiliser un objet ou se préparer à tirer. Lorsque tous les points d’action du personnage ont été utilisés, le joueur prend le contrôle d’un autre personnage[4].
De nombreux objets peuvent être trouvés lors des missions, incluant des grenades et des boucliers laser. Chacun d’eux offre des avantages lors des combats. Une grenade aveuglante peut par exemple faire perdre son tour à un ennemi, une grenade conventionnelle fait d’importants dégâts de zone et les équipements de détection permettent de repérer un ennemi caché. Ces objets doivent être utilisés à bon escient car ils ne sont disponibles qu’en quantité limitée. Comme les soldats du joueur, les ennemis peuvent utiliser des armes et des objets lors des combats[4].