Carmen Pujals est née à Buenos Aires, en Argentine et déménage à Barcelone à l'âge de cinq ans. Elle commence à étudier la biologie à l'Université de Barcelone en 1935, mais peu de temps après, son père ramène la famille à Buenos Aires, craignant le déclenchement de la guerre civile. En 1936, elle poursuit ses études à l'Université de Buenos Aires et obtient un diplôme en sciences naturelles[1].
Elle fait partie d'un groupe de quatre femmes scientifiques argentines qui se rendent en Antarctique en . Avec la biologiste marineIrene Bernasconi, la microbiologisteMaría Adela Caría(es) et la biologiste marine Elena Martínez Fontes(es), elles sont les premières femmes argentines à voyager sur le continent[3]. Au cours de son séjour, elle étudie la flore de l'archipel Palmer et collecte des algues marines de l'Antarctique conservées au Musée des sciences naturelles Bernardino Rivadavia[1],[4]. Elle effectue un deuxième voyage en Antarctique en 1971. La même année, Pujals passe également un mois à collecter des spécimens d'algues sur les îles Falkland à la demande de l'ambassade britannique[1].
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