Chocomyšl se trouve à 15 km à l'est-nord-est de Domažlice, à 35 km au sud-ouest de Plzeň et à 116 km au sud-ouest de Prague[4].
La commune est limitée par Koloveč au nord, par Kaničky à l'est, par Chudenice à l'est et au sud, et par Únějovice à l'ouest[5].