Après avoir joué et entraîné l'Étoile sportive La Ciotat, il devient en 2011 entraîneur de l'équipe féminine de l'Olympique de Marseille lors de sa refondation[1]. L'OM démarre au bas de la hiérarchie, dans le championnat du district de Provence[2], et accède en fin de saison via des barrages à la Division d'Honneur Challenger[3].
L'OM de Christophe Parra est promu la saison suivante en Division d'Honneur Élite[4], puis valide sa montée en deuxième division à l'issue de la saison 2013-2014. Lors de la saison 2014-2015, les Olympiennes terminent deuxième du groupe C de deuxième division, à cinq points du Nîmes Metropole Gard. La saison 2015-2016 se conclut sur la montée du club en première division[5], trente-quatre ans après leur dernière apparition[6] et un titre de championnes de France de D2 officialisé lors de l'avant-dernière journée[7]. La saison 2016-2017 voit les Olympiennes terminer au pied du podium de la D1, s'assurant la quatrième place dès la 21e journée[8]; Christophe Parra est désigné meilleur entraîneur de la D1 féminine de la saison par la Fédération française de football[9].
La saison 2017-2018 voit Christophe Parra et son équipe être relégués en deuxième division[10]; les Olympiennes remontent à l'issue de la saison 2018-2019[11] mais redescendent dans la foulée en 2020 dans une saison tronquée à cause de la pandémie de Covid-19[12].
Le , il prolonge son contrat avec le club phocéen[13].
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